Protein–RNA interactions for Protein: P39428

Traf1, TNF receptor-associated factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf1P39428 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Traf1P39428 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Traf1P39428 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Traf1P39428 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Traf1P39428 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Traf1P39428 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Traf1P39428 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Traf1P39428 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Traf1P39428 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Traf1P39428 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Traf1P39428 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Traf1P39428 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Traf1P39428 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Traf1P39428 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Traf1P39428 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Traf1P39428 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Traf1P39428 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Traf1P39428 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Traf1P39428 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Traf1P39428 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Traf1P39428 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Traf1P39428 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Traf1P39428 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Traf1P39428 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Traf1P39428 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Traf1P39428 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Traf1P39428 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Traf1P39428 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Traf1P39428 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Traf1P39428 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Traf1P39428 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Traf1P39428 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Traf1P39428 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Traf1P39428 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Traf1P39428 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Traf1P39428 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Traf1P39428 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Traf1P39428 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Traf1P39428 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Traf1P39428 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Traf1P39428 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Traf1P39428 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Traf1P39428 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Traf1P39428 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Traf1P39428 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Traf1P39428 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Traf1P39428 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Traf1P39428 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Traf1P39428 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Traf1P39428 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Traf1P39428 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Traf1P39428 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Traf1P39428 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Traf1P39428 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Traf1P39428 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Traf1P39428 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Traf1P39428 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Traf1P39428 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Traf1P39428 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Traf1P39428 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Traf1P39428 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Traf1P39428 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Traf1P39428 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Traf1P39428 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Traf1P39428 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Traf1P39428 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Traf1P39428 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Traf1P39428 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Traf1P39428 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Traf1P39428 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Traf1P39428 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Traf1P39428 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Traf1P39428 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Traf1P39428 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Traf1P39428 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Traf1P39428 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Traf1P39428 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Traf1P39428 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Traf1P39428 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Traf1P39428 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Traf1P39428 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Traf1P39428 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Traf1P39428 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Traf1P39428 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Traf1P39428 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Traf1P39428 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Traf1P39428 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Traf1P39428 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Traf1P39428 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Traf1P39428 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Traf1P39428 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Traf1P39428 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Traf1P39428 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Traf1P39428 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Traf1P39428 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Traf1P39428 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Traf1P39428 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Traf1P39428 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Traf1P39428 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Traf1P39428 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms