Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PtprkP35822 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PtprkP35822 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PtprkP35822 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PtprkP35822 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PtprkP35822 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PtprkP35822 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
PtprkP35822 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PtprkP35822 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PtprkP35822 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PtprkP35822 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PtprkP35822 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
PtprkP35822 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PtprkP35822 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PtprkP35822 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PtprkP35822 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PtprkP35822 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PtprkP35822 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PtprkP35822 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
PtprkP35822 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
PtprkP35822 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PtprkP35822 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PtprkP35822 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PtprkP35822 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PtprkP35822 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PtprkP35822 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PtprkP35822 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PtprkP35822 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
PtprkP35822 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
PtprkP35822 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PtprkP35822 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PtprkP35822 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PtprkP35822 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PtprkP35822 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PtprkP35822 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PtprkP35822 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PtprkP35822 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PtprkP35822 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PtprkP35822 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
PtprkP35822 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PtprkP35822 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PtprkP35822 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PtprkP35822 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PtprkP35822 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
PtprkP35822 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PtprkP35822 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PtprkP35822 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PtprkP35822 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PtprkP35822 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PtprkP35822 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PtprkP35822 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PtprkP35822 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PtprkP35822 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PtprkP35822 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PtprkP35822 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
PtprkP35822 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PtprkP35822 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PtprkP35822 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PtprkP35822 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PtprkP35822 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PtprkP35822 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
PtprkP35822 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
PtprkP35822 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
PtprkP35822 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PtprkP35822 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PtprkP35822 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PtprkP35822 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PtprkP35822 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PtprkP35822 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PtprkP35822 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PtprkP35822 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PtprkP35822 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PtprkP35822 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PtprkP35822 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PtprkP35822 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PtprkP35822 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PtprkP35822 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
PtprkP35822 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PtprkP35822 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PtprkP35822 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
PtprkP35822 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PtprkP35822 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PtprkP35822 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PtprkP35822 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PtprkP35822 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PtprkP35822 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PtprkP35822 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PtprkP35822 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PtprkP35822 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PtprkP35822 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PtprkP35822 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PtprkP35822 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
PtprkP35822 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PtprkP35822 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PtprkP35822 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PtprkP35822 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PtprkP35822 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PtprkP35822 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PtprkP35822 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PtprkP35822 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms