Protein–RNA interactions for Protein: P35419

Tpo, Thyroid peroxidase, mousemouse

Predictions only

Length 914 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TpoP35419 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TpoP35419 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TpoP35419 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TpoP35419 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TpoP35419 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TpoP35419 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TpoP35419 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TpoP35419 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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TpoP35419 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TpoP35419 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TpoP35419 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TpoP35419 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TpoP35419 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TpoP35419 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TpoP35419 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TpoP35419 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TpoP35419 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TpoP35419 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TpoP35419 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TpoP35419 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TpoP35419 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TpoP35419 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TpoP35419 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TpoP35419 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TpoP35419 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TpoP35419 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TpoP35419 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TpoP35419 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TpoP35419 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TpoP35419 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TpoP35419 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TpoP35419 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TpoP35419 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TpoP35419 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TpoP35419 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TpoP35419 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TpoP35419 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TpoP35419 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TpoP35419 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TpoP35419 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TpoP35419 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TpoP35419 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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TpoP35419 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TpoP35419 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TpoP35419 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TpoP35419 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TpoP35419 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TpoP35419 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TpoP35419 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TpoP35419 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TpoP35419 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TpoP35419 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TpoP35419 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TpoP35419 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TpoP35419 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TpoP35419 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TpoP35419 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TpoP35419 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TpoP35419 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
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TpoP35419 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TpoP35419 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TpoP35419 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TpoP35419 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TpoP35419 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TpoP35419 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TpoP35419 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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TpoP35419 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TpoP35419 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TpoP35419 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TpoP35419 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TpoP35419 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TpoP35419 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TpoP35419 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TpoP35419 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TpoP35419 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TpoP35419 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TpoP35419 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TpoP35419 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TpoP35419 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TpoP35419 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TpoP35419 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TpoP35419 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TpoP35419 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TpoP35419 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TpoP35419 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TpoP35419 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TpoP35419 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TpoP35419 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TpoP35419 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TpoP35419 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TpoP35419 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TpoP35419 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TpoP35419 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TpoP35419 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TpoP35419 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TpoP35419 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms