Protein–RNA interactions for Protein: P35242

Sftpa1, Pulmonary surfactant-associated protein A, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sftpa1P35242 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sftpa1P35242 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Sftpa1P35242 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sftpa1P35242 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sftpa1P35242 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sftpa1P35242 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Sftpa1P35242 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sftpa1P35242 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sftpa1P35242 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sftpa1P35242 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sftpa1P35242 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sftpa1P35242 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sftpa1P35242 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sftpa1P35242 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sftpa1P35242 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sftpa1P35242 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sftpa1P35242 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sftpa1P35242 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sftpa1P35242 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sftpa1P35242 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sftpa1P35242 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sftpa1P35242 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sftpa1P35242 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sftpa1P35242 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sftpa1P35242 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sftpa1P35242 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sftpa1P35242 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sftpa1P35242 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Sftpa1P35242 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sftpa1P35242 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sftpa1P35242 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Sftpa1P35242 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sftpa1P35242 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sftpa1P35242 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Sftpa1P35242 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sftpa1P35242 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sftpa1P35242 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sftpa1P35242 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sftpa1P35242 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sftpa1P35242 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Sftpa1P35242 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sftpa1P35242 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sftpa1P35242 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sftpa1P35242 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sftpa1P35242 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sftpa1P35242 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Sftpa1P35242 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sftpa1P35242 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sftpa1P35242 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sftpa1P35242 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sftpa1P35242 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sftpa1P35242 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sftpa1P35242 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sftpa1P35242 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sftpa1P35242 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sftpa1P35242 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sftpa1P35242 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sftpa1P35242 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sftpa1P35242 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sftpa1P35242 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sftpa1P35242 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Sftpa1P35242 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sftpa1P35242 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sftpa1P35242 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sftpa1P35242 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sftpa1P35242 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sftpa1P35242 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sftpa1P35242 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sftpa1P35242 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Sftpa1P35242 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sftpa1P35242 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sftpa1P35242 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sftpa1P35242 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sftpa1P35242 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sftpa1P35242 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sftpa1P35242 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sftpa1P35242 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sftpa1P35242 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sftpa1P35242 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sftpa1P35242 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sftpa1P35242 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sftpa1P35242 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sftpa1P35242 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sftpa1P35242 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sftpa1P35242 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sftpa1P35242 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sftpa1P35242 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sftpa1P35242 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sftpa1P35242 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sftpa1P35242 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sftpa1P35242 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sftpa1P35242 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sftpa1P35242 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sftpa1P35242 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sftpa1P35242 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sftpa1P35242 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sftpa1P35242 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sftpa1P35242 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sftpa1P35242 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sftpa1P35242 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms