Protein–RNA interactions for Protein: P32067

Ssb, Lupus La protein homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SsbP32067 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SsbP32067 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SsbP32067 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SsbP32067 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SsbP32067 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SsbP32067 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SsbP32067 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SsbP32067 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SsbP32067 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SsbP32067 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SsbP32067 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SsbP32067 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SsbP32067 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SsbP32067 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SsbP32067 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SsbP32067 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SsbP32067 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SsbP32067 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SsbP32067 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SsbP32067 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SsbP32067 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SsbP32067 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SsbP32067 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SsbP32067 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SsbP32067 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SsbP32067 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SsbP32067 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SsbP32067 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SsbP32067 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SsbP32067 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SsbP32067 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SsbP32067 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SsbP32067 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SsbP32067 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SsbP32067 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SsbP32067 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SsbP32067 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SsbP32067 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SsbP32067 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SsbP32067 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SsbP32067 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SsbP32067 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SsbP32067 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SsbP32067 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SsbP32067 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SsbP32067 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SsbP32067 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SsbP32067 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SsbP32067 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SsbP32067 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SsbP32067 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SsbP32067 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SsbP32067 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SsbP32067 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SsbP32067 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SsbP32067 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SsbP32067 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SsbP32067 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SsbP32067 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SsbP32067 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SsbP32067 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SsbP32067 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SsbP32067 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SsbP32067 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SsbP32067 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SsbP32067 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SsbP32067 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SsbP32067 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SsbP32067 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SsbP32067 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SsbP32067 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SsbP32067 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SsbP32067 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SsbP32067 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SsbP32067 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SsbP32067 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SsbP32067 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SsbP32067 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SsbP32067 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SsbP32067 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SsbP32067 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SsbP32067 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SsbP32067 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SsbP32067 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SsbP32067 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SsbP32067 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SsbP32067 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SsbP32067 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SsbP32067 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SsbP32067 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SsbP32067 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SsbP32067 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SsbP32067 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SsbP32067 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SsbP32067 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SsbP32067 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SsbP32067 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SsbP32067 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SsbP32067 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SsbP32067 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms