Protein–RNA interactions for Protein: P30999

Ctnnd1, Catenin delta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnd1P30999 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ctnnd1P30999 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ctnnd1P30999 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ctnnd1P30999 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ctnnd1P30999 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ctnnd1P30999 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ctnnd1P30999 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ctnnd1P30999 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ctnnd1P30999 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ctnnd1P30999 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ctnnd1P30999 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ctnnd1P30999 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ctnnd1P30999 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ctnnd1P30999 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ctnnd1P30999 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ctnnd1P30999 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ctnnd1P30999 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ctnnd1P30999 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ctnnd1P30999 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ctnnd1P30999 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ctnnd1P30999 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ctnnd1P30999 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ctnnd1P30999 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ctnnd1P30999 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ctnnd1P30999 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ctnnd1P30999 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ctnnd1P30999 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ctnnd1P30999 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ctnnd1P30999 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ctnnd1P30999 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Ctnnd1P30999 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ctnnd1P30999 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ctnnd1P30999 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ctnnd1P30999 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ctnnd1P30999 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Ctnnd1P30999 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ctnnd1P30999 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ctnnd1P30999 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ctnnd1P30999 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ctnnd1P30999 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ctnnd1P30999 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ctnnd1P30999 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ctnnd1P30999 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ctnnd1P30999 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ctnnd1P30999 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ctnnd1P30999 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ctnnd1P30999 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ctnnd1P30999 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ctnnd1P30999 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ctnnd1P30999 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Ctnnd1P30999 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Ctnnd1P30999 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ctnnd1P30999 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ctnnd1P30999 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ctnnd1P30999 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ctnnd1P30999 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ctnnd1P30999 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ctnnd1P30999 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ctnnd1P30999 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ctnnd1P30999 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ctnnd1P30999 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Ctnnd1P30999 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ctnnd1P30999 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ctnnd1P30999 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ctnnd1P30999 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ctnnd1P30999 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ctnnd1P30999 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ctnnd1P30999 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Ctnnd1P30999 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ctnnd1P30999 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ctnnd1P30999 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ctnnd1P30999 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ctnnd1P30999 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ctnnd1P30999 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ctnnd1P30999 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ctnnd1P30999 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ctnnd1P30999 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ctnnd1P30999 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ctnnd1P30999 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ctnnd1P30999 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ctnnd1P30999 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ctnnd1P30999 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ctnnd1P30999 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ctnnd1P30999 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ctnnd1P30999 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ctnnd1P30999 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ctnnd1P30999 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ctnnd1P30999 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ctnnd1P30999 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ctnnd1P30999 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ctnnd1P30999 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ctnnd1P30999 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ctnnd1P30999 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ctnnd1P30999 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ctnnd1P30999 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Ctnnd1P30999 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ctnnd1P30999 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ctnnd1P30999 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ctnnd1P30999 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ctnnd1P30999 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms