Protein–RNA interactions for Protein: P29268

Ctgf, Connective tissue growth factor, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtgfP29268 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CtgfP29268 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CtgfP29268 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CtgfP29268 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CtgfP29268 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CtgfP29268 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CtgfP29268 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CtgfP29268 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CtgfP29268 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CtgfP29268 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CtgfP29268 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CtgfP29268 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CtgfP29268 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CtgfP29268 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CtgfP29268 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CtgfP29268 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CtgfP29268 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CtgfP29268 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CtgfP29268 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CtgfP29268 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CtgfP29268 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CtgfP29268 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CtgfP29268 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CtgfP29268 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CtgfP29268 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CtgfP29268 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CtgfP29268 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CtgfP29268 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CtgfP29268 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CtgfP29268 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CtgfP29268 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CtgfP29268 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CtgfP29268 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CtgfP29268 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CtgfP29268 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CtgfP29268 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CtgfP29268 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CtgfP29268 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CtgfP29268 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CtgfP29268 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CtgfP29268 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CtgfP29268 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CtgfP29268 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CtgfP29268 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CtgfP29268 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CtgfP29268 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CtgfP29268 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CtgfP29268 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CtgfP29268 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CtgfP29268 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CtgfP29268 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CtgfP29268 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CtgfP29268 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CtgfP29268 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CtgfP29268 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CtgfP29268 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CtgfP29268 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CtgfP29268 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CtgfP29268 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CtgfP29268 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CtgfP29268 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CtgfP29268 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CtgfP29268 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CtgfP29268 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CtgfP29268 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CtgfP29268 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CtgfP29268 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CtgfP29268 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CtgfP29268 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CtgfP29268 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CtgfP29268 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CtgfP29268 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CtgfP29268 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CtgfP29268 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CtgfP29268 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CtgfP29268 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CtgfP29268 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CtgfP29268 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CtgfP29268 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CtgfP29268 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CtgfP29268 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CtgfP29268 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CtgfP29268 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CtgfP29268 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CtgfP29268 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CtgfP29268 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CtgfP29268 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CtgfP29268 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CtgfP29268 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CtgfP29268 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CtgfP29268 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CtgfP29268 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CtgfP29268 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CtgfP29268 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CtgfP29268 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CtgfP29268 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CtgfP29268 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CtgfP29268 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CtgfP29268 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CtgfP29268 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms