Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PtprmP28828 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PtprmP28828 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PtprmP28828 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PtprmP28828 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PtprmP28828 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PtprmP28828 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PtprmP28828 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PtprmP28828 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PtprmP28828 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PtprmP28828 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PtprmP28828 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PtprmP28828 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PtprmP28828 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PtprmP28828 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PtprmP28828 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PtprmP28828 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PtprmP28828 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PtprmP28828 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PtprmP28828 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PtprmP28828 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PtprmP28828 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PtprmP28828 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PtprmP28828 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PtprmP28828 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PtprmP28828 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PtprmP28828 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PtprmP28828 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PtprmP28828 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PtprmP28828 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PtprmP28828 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PtprmP28828 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PtprmP28828 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PtprmP28828 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PtprmP28828 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PtprmP28828 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PtprmP28828 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PtprmP28828 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PtprmP28828 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PtprmP28828 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PtprmP28828 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PtprmP28828 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PtprmP28828 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PtprmP28828 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PtprmP28828 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PtprmP28828 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PtprmP28828 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PtprmP28828 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PtprmP28828 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PtprmP28828 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PtprmP28828 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PtprmP28828 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PtprmP28828 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PtprmP28828 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PtprmP28828 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PtprmP28828 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PtprmP28828 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PtprmP28828 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PtprmP28828 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PtprmP28828 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PtprmP28828 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PtprmP28828 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PtprmP28828 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PtprmP28828 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PtprmP28828 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
PtprmP28828 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PtprmP28828 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PtprmP28828 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PtprmP28828 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PtprmP28828 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PtprmP28828 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PtprmP28828 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PtprmP28828 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PtprmP28828 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PtprmP28828 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PtprmP28828 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PtprmP28828 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PtprmP28828 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PtprmP28828 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PtprmP28828 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PtprmP28828 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PtprmP28828 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PtprmP28828 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PtprmP28828 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PtprmP28828 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PtprmP28828 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PtprmP28828 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PtprmP28828 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PtprmP28828 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PtprmP28828 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PtprmP28828 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PtprmP28828 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PtprmP28828 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PtprmP28828 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PtprmP28828 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PtprmP28828 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PtprmP28828 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PtprmP28828 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PtprmP28828 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PtprmP28828 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
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