Protein–RNA interactions for Protein: P28078

H2-DMa, Class II histocompatibility antigen, M alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-DMaP28078 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
H2-DMaP28078 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
H2-DMaP28078 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
H2-DMaP28078 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
H2-DMaP28078 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
H2-DMaP28078 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
H2-DMaP28078 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
H2-DMaP28078 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
H2-DMaP28078 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
H2-DMaP28078 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
H2-DMaP28078 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
H2-DMaP28078 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
H2-DMaP28078 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
H2-DMaP28078 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
H2-DMaP28078 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
H2-DMaP28078 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
H2-DMaP28078 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
H2-DMaP28078 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
H2-DMaP28078 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
H2-DMaP28078 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC14.21□□□□□ -0.14
H2-DMaP28078 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
H2-DMaP28078 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
H2-DMaP28078 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
H2-DMaP28078 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
H2-DMaP28078 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
H2-DMaP28078 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
H2-DMaP28078 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
H2-DMaP28078 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
H2-DMaP28078 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
H2-DMaP28078 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
H2-DMaP28078 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
H2-DMaP28078 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
H2-DMaP28078 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
H2-DMaP28078 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
H2-DMaP28078 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
H2-DMaP28078 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
H2-DMaP28078 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
H2-DMaP28078 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
H2-DMaP28078 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
H2-DMaP28078 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
H2-DMaP28078 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
H2-DMaP28078 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
H2-DMaP28078 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
H2-DMaP28078 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
H2-DMaP28078 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
H2-DMaP28078 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
H2-DMaP28078 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
H2-DMaP28078 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
H2-DMaP28078 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
H2-DMaP28078 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
H2-DMaP28078 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
H2-DMaP28078 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
H2-DMaP28078 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
H2-DMaP28078 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
H2-DMaP28078 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
H2-DMaP28078 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
H2-DMaP28078 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
H2-DMaP28078 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
H2-DMaP28078 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
H2-DMaP28078 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
H2-DMaP28078 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
H2-DMaP28078 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
H2-DMaP28078 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
H2-DMaP28078 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
H2-DMaP28078 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
H2-DMaP28078 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
H2-DMaP28078 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
H2-DMaP28078 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
H2-DMaP28078 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
H2-DMaP28078 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
H2-DMaP28078 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
H2-DMaP28078 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
H2-DMaP28078 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
H2-DMaP28078 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
H2-DMaP28078 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
H2-DMaP28078 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
H2-DMaP28078 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
H2-DMaP28078 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
H2-DMaP28078 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
H2-DMaP28078 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
H2-DMaP28078 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
H2-DMaP28078 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
H2-DMaP28078 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
H2-DMaP28078 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
H2-DMaP28078 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
H2-DMaP28078 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
H2-DMaP28078 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
H2-DMaP28078 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
H2-DMaP28078 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
H2-DMaP28078 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
H2-DMaP28078 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
H2-DMaP28078 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
H2-DMaP28078 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
H2-DMaP28078 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
H2-DMaP28078 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
H2-DMaP28078 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
H2-DMaP28078 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
H2-DMaP28078 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
H2-DMaP28078 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
H2-DMaP28078 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.3 ms