Protein–RNA interactions for Protein: P24788

Cdk11b, Cyclin-dependent kinase 11B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk11bP24788 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cdk11bP24788 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cdk11bP24788 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cdk11bP24788 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cdk11bP24788 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cdk11bP24788 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cdk11bP24788 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cdk11bP24788 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cdk11bP24788 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cdk11bP24788 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cdk11bP24788 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cdk11bP24788 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cdk11bP24788 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cdk11bP24788 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cdk11bP24788 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cdk11bP24788 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cdk11bP24788 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cdk11bP24788 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cdk11bP24788 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cdk11bP24788 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cdk11bP24788 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Cdk11bP24788 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cdk11bP24788 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cdk11bP24788 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cdk11bP24788 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cdk11bP24788 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cdk11bP24788 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cdk11bP24788 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cdk11bP24788 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cdk11bP24788 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cdk11bP24788 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cdk11bP24788 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cdk11bP24788 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cdk11bP24788 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cdk11bP24788 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Cdk11bP24788 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cdk11bP24788 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cdk11bP24788 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Cdk11bP24788 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cdk11bP24788 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cdk11bP24788 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cdk11bP24788 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cdk11bP24788 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cdk11bP24788 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cdk11bP24788 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cdk11bP24788 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cdk11bP24788 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cdk11bP24788 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Cdk11bP24788 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cdk11bP24788 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cdk11bP24788 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cdk11bP24788 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cdk11bP24788 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cdk11bP24788 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cdk11bP24788 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cdk11bP24788 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cdk11bP24788 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cdk11bP24788 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cdk11bP24788 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cdk11bP24788 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cdk11bP24788 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cdk11bP24788 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cdk11bP24788 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cdk11bP24788 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Cdk11bP24788 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cdk11bP24788 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cdk11bP24788 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Cdk11bP24788 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Cdk11bP24788 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cdk11bP24788 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cdk11bP24788 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cdk11bP24788 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cdk11bP24788 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cdk11bP24788 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cdk11bP24788 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Cdk11bP24788 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cdk11bP24788 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cdk11bP24788 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cdk11bP24788 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cdk11bP24788 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cdk11bP24788 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cdk11bP24788 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cdk11bP24788 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cdk11bP24788 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cdk11bP24788 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cdk11bP24788 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cdk11bP24788 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cdk11bP24788 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cdk11bP24788 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cdk11bP24788 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cdk11bP24788 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cdk11bP24788 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cdk11bP24788 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cdk11bP24788 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cdk11bP24788 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cdk11bP24788 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cdk11bP24788 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cdk11bP24788 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cdk11bP24788 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Cdk11bP24788 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms