Protein–RNA interactions for Protein: P23979

Htr3a, 5-hydroxytryptamine receptor 3A, mousemouse

Predictions only

Length 487 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htr3aP23979 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Htr3aP23979 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Htr3aP23979 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Htr3aP23979 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Htr3aP23979 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Htr3aP23979 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Htr3aP23979 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Htr3aP23979 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Htr3aP23979 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Htr3aP23979 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Htr3aP23979 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Htr3aP23979 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Htr3aP23979 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Htr3aP23979 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Htr3aP23979 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Htr3aP23979 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Htr3aP23979 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Htr3aP23979 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Htr3aP23979 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Htr3aP23979 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Htr3aP23979 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Htr3aP23979 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Htr3aP23979 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Htr3aP23979 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Htr3aP23979 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Htr3aP23979 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Htr3aP23979 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Htr3aP23979 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Htr3aP23979 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Htr3aP23979 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Htr3aP23979 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Htr3aP23979 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Htr3aP23979 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Htr3aP23979 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Htr3aP23979 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Htr3aP23979 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Htr3aP23979 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Htr3aP23979 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Htr3aP23979 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Htr3aP23979 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Htr3aP23979 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Htr3aP23979 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Htr3aP23979 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Htr3aP23979 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Htr3aP23979 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Htr3aP23979 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Htr3aP23979 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Htr3aP23979 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Htr3aP23979 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Htr3aP23979 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Htr3aP23979 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Htr3aP23979 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Htr3aP23979 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Htr3aP23979 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Htr3aP23979 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Htr3aP23979 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Htr3aP23979 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Htr3aP23979 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Htr3aP23979 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Htr3aP23979 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Htr3aP23979 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Htr3aP23979 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Htr3aP23979 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Htr3aP23979 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Htr3aP23979 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Htr3aP23979 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Htr3aP23979 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Htr3aP23979 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Htr3aP23979 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Htr3aP23979 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Htr3aP23979 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Htr3aP23979 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Htr3aP23979 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Htr3aP23979 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Htr3aP23979 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Htr3aP23979 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Htr3aP23979 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Htr3aP23979 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Htr3aP23979 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Htr3aP23979 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Htr3aP23979 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Htr3aP23979 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Htr3aP23979 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Htr3aP23979 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Htr3aP23979 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Htr3aP23979 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Htr3aP23979 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Htr3aP23979 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Htr3aP23979 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Htr3aP23979 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Htr3aP23979 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Htr3aP23979 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Htr3aP23979 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Htr3aP23979 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Htr3aP23979 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Htr3aP23979 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Htr3aP23979 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Htr3aP23979 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Htr3aP23979 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Htr3aP23979 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms