Protein–RNA interactions for Protein: P23116

Eif3a, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3aP23116 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Eif3aP23116 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Eif3aP23116 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Eif3aP23116 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Eif3aP23116 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Eif3aP23116 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Eif3aP23116 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Eif3aP23116 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Eif3aP23116 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Eif3aP23116 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Eif3aP23116 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Eif3aP23116 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Eif3aP23116 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Eif3aP23116 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Eif3aP23116 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Eif3aP23116 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Eif3aP23116 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Eif3aP23116 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Eif3aP23116 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Eif3aP23116 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Eif3aP23116 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Eif3aP23116 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Eif3aP23116 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Eif3aP23116 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Eif3aP23116 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Eif3aP23116 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Eif3aP23116 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Eif3aP23116 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Eif3aP23116 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Eif3aP23116 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Eif3aP23116 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Eif3aP23116 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Eif3aP23116 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Eif3aP23116 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Eif3aP23116 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Eif3aP23116 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Eif3aP23116 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Eif3aP23116 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Eif3aP23116 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Eif3aP23116 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Eif3aP23116 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Eif3aP23116 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Eif3aP23116 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Eif3aP23116 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Eif3aP23116 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Eif3aP23116 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Eif3aP23116 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Eif3aP23116 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Eif3aP23116 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Eif3aP23116 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Eif3aP23116 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Eif3aP23116 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Eif3aP23116 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Eif3aP23116 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Eif3aP23116 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Eif3aP23116 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Eif3aP23116 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Eif3aP23116 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Eif3aP23116 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Eif3aP23116 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Eif3aP23116 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Eif3aP23116 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Eif3aP23116 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Eif3aP23116 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Eif3aP23116 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Eif3aP23116 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Eif3aP23116 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Eif3aP23116 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Eif3aP23116 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Eif3aP23116 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Eif3aP23116 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Eif3aP23116 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Eif3aP23116 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Eif3aP23116 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Eif3aP23116 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Eif3aP23116 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Eif3aP23116 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Eif3aP23116 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Eif3aP23116 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Eif3aP23116 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Eif3aP23116 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Eif3aP23116 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Eif3aP23116 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Eif3aP23116 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Eif3aP23116 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Eif3aP23116 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Eif3aP23116 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Eif3aP23116 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Eif3aP23116 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Eif3aP23116 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Eif3aP23116 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Eif3aP23116 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Eif3aP23116 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Eif3aP23116 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Eif3aP23116 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Eif3aP23116 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Eif3aP23116 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Eif3aP23116 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Eif3aP23116 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Eif3aP23116 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.4 ms