Protein–RNA interactions for Protein: P20801

Tnnc2, Troponin C, skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc2P20801 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tnnc2P20801 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tnnc2P20801 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tnnc2P20801 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tnnc2P20801 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tnnc2P20801 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tnnc2P20801 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tnnc2P20801 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tnnc2P20801 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tnnc2P20801 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tnnc2P20801 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tnnc2P20801 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tnnc2P20801 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tnnc2P20801 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tnnc2P20801 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tnnc2P20801 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tnnc2P20801 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tnnc2P20801 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tnnc2P20801 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tnnc2P20801 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tnnc2P20801 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tnnc2P20801 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tnnc2P20801 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tnnc2P20801 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tnnc2P20801 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tnnc2P20801 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tnnc2P20801 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tnnc2P20801 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tnnc2P20801 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tnnc2P20801 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tnnc2P20801 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tnnc2P20801 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tnnc2P20801 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tnnc2P20801 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tnnc2P20801 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tnnc2P20801 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tnnc2P20801 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tnnc2P20801 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tnnc2P20801 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tnnc2P20801 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tnnc2P20801 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tnnc2P20801 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tnnc2P20801 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tnnc2P20801 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tnnc2P20801 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tnnc2P20801 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tnnc2P20801 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tnnc2P20801 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tnnc2P20801 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tnnc2P20801 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tnnc2P20801 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tnnc2P20801 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tnnc2P20801 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tnnc2P20801 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tnnc2P20801 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tnnc2P20801 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tnnc2P20801 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tnnc2P20801 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tnnc2P20801 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Tnnc2P20801 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Tnnc2P20801 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tnnc2P20801 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tnnc2P20801 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tnnc2P20801 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tnnc2P20801 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tnnc2P20801 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tnnc2P20801 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tnnc2P20801 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tnnc2P20801 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tnnc2P20801 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tnnc2P20801 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tnnc2P20801 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Tnnc2P20801 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tnnc2P20801 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tnnc2P20801 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tnnc2P20801 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tnnc2P20801 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tnnc2P20801 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tnnc2P20801 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tnnc2P20801 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tnnc2P20801 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tnnc2P20801 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tnnc2P20801 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tnnc2P20801 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tnnc2P20801 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tnnc2P20801 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tnnc2P20801 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tnnc2P20801 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tnnc2P20801 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tnnc2P20801 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tnnc2P20801 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tnnc2P20801 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tnnc2P20801 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tnnc2P20801 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tnnc2P20801 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tnnc2P20801 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tnnc2P20801 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tnnc2P20801 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tnnc2P20801 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tnnc2P20801 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms