Protein–RNA interactions for Protein: P20263

Pou5f1, POU domain, class 5, transcription factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou5f1P20263 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pou5f1P20263 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pou5f1P20263 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pou5f1P20263 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pou5f1P20263 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pou5f1P20263 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pou5f1P20263 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Pou5f1P20263 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pou5f1P20263 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pou5f1P20263 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pou5f1P20263 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Pou5f1P20263 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Pou5f1P20263 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pou5f1P20263 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pou5f1P20263 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pou5f1P20263 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pou5f1P20263 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pou5f1P20263 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pou5f1P20263 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pou5f1P20263 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pou5f1P20263 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pou5f1P20263 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pou5f1P20263 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pou5f1P20263 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pou5f1P20263 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pou5f1P20263 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pou5f1P20263 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pou5f1P20263 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pou5f1P20263 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pou5f1P20263 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pou5f1P20263 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Pou5f1P20263 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pou5f1P20263 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pou5f1P20263 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pou5f1P20263 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pou5f1P20263 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pou5f1P20263 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pou5f1P20263 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pou5f1P20263 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pou5f1P20263 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pou5f1P20263 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pou5f1P20263 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Pou5f1P20263 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pou5f1P20263 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pou5f1P20263 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pou5f1P20263 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pou5f1P20263 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pou5f1P20263 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pou5f1P20263 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pou5f1P20263 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pou5f1P20263 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pou5f1P20263 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pou5f1P20263 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pou5f1P20263 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pou5f1P20263 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pou5f1P20263 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pou5f1P20263 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Pou5f1P20263 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pou5f1P20263 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pou5f1P20263 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pou5f1P20263 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pou5f1P20263 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pou5f1P20263 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pou5f1P20263 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pou5f1P20263 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pou5f1P20263 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pou5f1P20263 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pou5f1P20263 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pou5f1P20263 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pou5f1P20263 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pou5f1P20263 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pou5f1P20263 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pou5f1P20263 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pou5f1P20263 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Pou5f1P20263 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pou5f1P20263 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Pou5f1P20263 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Pou5f1P20263 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pou5f1P20263 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pou5f1P20263 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pou5f1P20263 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pou5f1P20263 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pou5f1P20263 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pou5f1P20263 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pou5f1P20263 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pou5f1P20263 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pou5f1P20263 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pou5f1P20263 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Pou5f1P20263 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pou5f1P20263 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pou5f1P20263 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pou5f1P20263 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pou5f1P20263 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pou5f1P20263 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pou5f1P20263 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pou5f1P20263 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pou5f1P20263 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Pou5f1P20263 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Pou5f1P20263 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pou5f1P20263 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms