Protein–RNA interactions for Protein: P20033

Pdgfa, Platelet-derived growth factor subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfaP20033 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PdgfaP20033 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PdgfaP20033 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PdgfaP20033 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PdgfaP20033 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PdgfaP20033 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PdgfaP20033 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PdgfaP20033 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PdgfaP20033 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PdgfaP20033 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PdgfaP20033 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PdgfaP20033 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PdgfaP20033 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PdgfaP20033 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PdgfaP20033 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PdgfaP20033 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PdgfaP20033 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PdgfaP20033 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PdgfaP20033 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PdgfaP20033 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PdgfaP20033 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PdgfaP20033 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PdgfaP20033 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PdgfaP20033 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PdgfaP20033 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PdgfaP20033 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PdgfaP20033 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PdgfaP20033 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PdgfaP20033 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PdgfaP20033 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PdgfaP20033 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PdgfaP20033 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PdgfaP20033 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PdgfaP20033 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PdgfaP20033 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PdgfaP20033 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PdgfaP20033 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PdgfaP20033 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PdgfaP20033 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PdgfaP20033 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PdgfaP20033 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PdgfaP20033 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PdgfaP20033 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PdgfaP20033 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PdgfaP20033 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PdgfaP20033 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PdgfaP20033 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PdgfaP20033 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PdgfaP20033 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
PdgfaP20033 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PdgfaP20033 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PdgfaP20033 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PdgfaP20033 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PdgfaP20033 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PdgfaP20033 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PdgfaP20033 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PdgfaP20033 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PdgfaP20033 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PdgfaP20033 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PdgfaP20033 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PdgfaP20033 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PdgfaP20033 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PdgfaP20033 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PdgfaP20033 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PdgfaP20033 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PdgfaP20033 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PdgfaP20033 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PdgfaP20033 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PdgfaP20033 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PdgfaP20033 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PdgfaP20033 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PdgfaP20033 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PdgfaP20033 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PdgfaP20033 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PdgfaP20033 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PdgfaP20033 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PdgfaP20033 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PdgfaP20033 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PdgfaP20033 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PdgfaP20033 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PdgfaP20033 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PdgfaP20033 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PdgfaP20033 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PdgfaP20033 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PdgfaP20033 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PdgfaP20033 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PdgfaP20033 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PdgfaP20033 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PdgfaP20033 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PdgfaP20033 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PdgfaP20033 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PdgfaP20033 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PdgfaP20033 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PdgfaP20033 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PdgfaP20033 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PdgfaP20033 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PdgfaP20033 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PdgfaP20033 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PdgfaP20033 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PdgfaP20033 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms