Protein–RNA interactions for Protein: P19785

Esr1, Estrogen receptor, mousemouse

Predictions only

Length 599 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Esr1P19785 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Esr1P19785 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Esr1P19785 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Esr1P19785 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Esr1P19785 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Esr1P19785 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Esr1P19785 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Esr1P19785 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Esr1P19785 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Esr1P19785 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Esr1P19785 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Esr1P19785 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Esr1P19785 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Esr1P19785 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Esr1P19785 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Esr1P19785 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Esr1P19785 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Esr1P19785 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Esr1P19785 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Esr1P19785 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Esr1P19785 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Esr1P19785 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Esr1P19785 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Esr1P19785 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Esr1P19785 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Esr1P19785 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Esr1P19785 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Esr1P19785 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Esr1P19785 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Esr1P19785 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Esr1P19785 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Esr1P19785 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Esr1P19785 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Esr1P19785 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Esr1P19785 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Esr1P19785 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Esr1P19785 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Esr1P19785 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Esr1P19785 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Esr1P19785 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Esr1P19785 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Esr1P19785 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Esr1P19785 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Esr1P19785 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Esr1P19785 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Esr1P19785 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Esr1P19785 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Esr1P19785 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Esr1P19785 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Esr1P19785 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Esr1P19785 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Esr1P19785 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Esr1P19785 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Esr1P19785 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Esr1P19785 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Esr1P19785 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Esr1P19785 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Esr1P19785 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Esr1P19785 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Esr1P19785 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Esr1P19785 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Esr1P19785 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Esr1P19785 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Esr1P19785 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Esr1P19785 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Esr1P19785 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Esr1P19785 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Esr1P19785 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Esr1P19785 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Esr1P19785 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Esr1P19785 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Esr1P19785 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Esr1P19785 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Esr1P19785 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Esr1P19785 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Esr1P19785 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Esr1P19785 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Esr1P19785 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Esr1P19785 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Esr1P19785 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Esr1P19785 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Esr1P19785 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Esr1P19785 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Esr1P19785 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Esr1P19785 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Esr1P19785 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Esr1P19785 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Esr1P19785 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Esr1P19785 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Esr1P19785 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Esr1P19785 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Esr1P19785 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Esr1P19785 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Esr1P19785 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Esr1P19785 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Esr1P19785 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms