Protein–RNA interactions for Protein: P18533

Ig heavy chain V region 733, mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18533 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P18533 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P18533 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P18533 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P18533 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P18533 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P18533 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P18533 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P18533 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P18533 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P18533 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
P18533 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P18533 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P18533 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P18533 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P18533 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P18533 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P18533 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P18533 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P18533 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P18533 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P18533 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P18533 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P18533 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P18533 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P18533 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P18533 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P18533 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P18533 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P18533 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P18533 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
P18533 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P18533 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P18533 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P18533 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P18533 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P18533 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P18533 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P18533 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P18533 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P18533 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P18533 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P18533 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P18533 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P18533 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
P18533 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
P18533 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P18533 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P18533 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P18533 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P18533 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P18533 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P18533 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P18533 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P18533 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P18533 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P18533 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P18533 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P18533 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P18533 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P18533 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P18533 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P18533 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P18533 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P18533 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P18533 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P18533 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P18533 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P18533 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P18533 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P18533 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
P18533 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P18533 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
P18533 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P18533 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P18533 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P18533 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P18533 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P18533 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P18533 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P18533 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P18533 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P18533 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P18533 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P18533 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P18533 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P18533 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P18533 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P18533 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P18533 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P18533 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P18533 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P18533 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P18533 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
P18533 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P18533 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P18533 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P18533 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P18533 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P18533 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms