Protein–RNA interactions for Protein: P18052

Ptpra, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, mousemouse

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Length 829 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpraP18052 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
PtpraP18052 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
PtpraP18052 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PtpraP18052 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PtpraP18052 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PtpraP18052 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PtpraP18052 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PtpraP18052 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
PtpraP18052 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PtpraP18052 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PtpraP18052 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PtpraP18052 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PtpraP18052 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PtpraP18052 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PtpraP18052 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PtpraP18052 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PtpraP18052 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PtpraP18052 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
PtpraP18052 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
PtpraP18052 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PtpraP18052 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PtpraP18052 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PtpraP18052 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PtpraP18052 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PtpraP18052 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PtpraP18052 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
PtpraP18052 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PtpraP18052 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
PtpraP18052 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PtpraP18052 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PtpraP18052 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PtpraP18052 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PtpraP18052 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PtpraP18052 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PtpraP18052 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PtpraP18052 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
PtpraP18052 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PtpraP18052 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PtpraP18052 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PtpraP18052 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PtpraP18052 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PtpraP18052 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PtpraP18052 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PtpraP18052 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PtpraP18052 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PtpraP18052 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PtpraP18052 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PtpraP18052 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PtpraP18052 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PtpraP18052 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PtpraP18052 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PtpraP18052 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PtpraP18052 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PtpraP18052 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PtpraP18052 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PtpraP18052 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PtpraP18052 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PtpraP18052 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PtpraP18052 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PtpraP18052 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PtpraP18052 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PtpraP18052 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PtpraP18052 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PtpraP18052 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PtpraP18052 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PtpraP18052 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
PtpraP18052 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PtpraP18052 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PtpraP18052 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PtpraP18052 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PtpraP18052 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PtpraP18052 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PtpraP18052 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PtpraP18052 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PtpraP18052 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PtpraP18052 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PtpraP18052 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PtpraP18052 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PtpraP18052 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PtpraP18052 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PtpraP18052 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PtpraP18052 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PtpraP18052 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PtpraP18052 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PtpraP18052 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PtpraP18052 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
PtpraP18052 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
PtpraP18052 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PtpraP18052 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
PtpraP18052 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PtpraP18052 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PtpraP18052 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PtpraP18052 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PtpraP18052 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
PtpraP18052 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PtpraP18052 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PtpraP18052 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PtpraP18052 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PtpraP18052 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PtpraP18052 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.4 ms