Protein–RNA interactions for Protein: P17918

Pcna, Proliferating cell nuclear antigen, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcnaP17918 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PcnaP17918 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PcnaP17918 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PcnaP17918 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PcnaP17918 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PcnaP17918 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PcnaP17918 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PcnaP17918 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PcnaP17918 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PcnaP17918 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PcnaP17918 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PcnaP17918 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PcnaP17918 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PcnaP17918 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PcnaP17918 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PcnaP17918 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PcnaP17918 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PcnaP17918 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PcnaP17918 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PcnaP17918 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PcnaP17918 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PcnaP17918 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PcnaP17918 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PcnaP17918 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PcnaP17918 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PcnaP17918 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PcnaP17918 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PcnaP17918 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PcnaP17918 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PcnaP17918 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PcnaP17918 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PcnaP17918 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PcnaP17918 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PcnaP17918 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PcnaP17918 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PcnaP17918 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PcnaP17918 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PcnaP17918 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PcnaP17918 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PcnaP17918 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PcnaP17918 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PcnaP17918 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PcnaP17918 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PcnaP17918 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PcnaP17918 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PcnaP17918 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PcnaP17918 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PcnaP17918 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PcnaP17918 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PcnaP17918 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PcnaP17918 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PcnaP17918 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PcnaP17918 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PcnaP17918 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PcnaP17918 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PcnaP17918 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PcnaP17918 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PcnaP17918 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PcnaP17918 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PcnaP17918 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PcnaP17918 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PcnaP17918 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PcnaP17918 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PcnaP17918 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PcnaP17918 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PcnaP17918 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PcnaP17918 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PcnaP17918 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PcnaP17918 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PcnaP17918 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PcnaP17918 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PcnaP17918 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PcnaP17918 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PcnaP17918 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PcnaP17918 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PcnaP17918 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PcnaP17918 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
PcnaP17918 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
PcnaP17918 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PcnaP17918 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PcnaP17918 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PcnaP17918 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PcnaP17918 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PcnaP17918 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PcnaP17918 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PcnaP17918 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PcnaP17918 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PcnaP17918 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PcnaP17918 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PcnaP17918 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PcnaP17918 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PcnaP17918 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PcnaP17918 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PcnaP17918 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PcnaP17918 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PcnaP17918 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PcnaP17918 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PcnaP17918 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PcnaP17918 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PcnaP17918 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms