Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC11.02□□□□□ -0.64
Vpreb2P13373 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Vpreb2P13373 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Vpreb2P13373 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Vpreb2P13373 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Vpreb2P13373 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Vpreb2P13373 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Vpreb2P13373 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Vpreb2P13373 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Vpreb2P13373 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Vpreb2P13373 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Vpreb2P13373 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Vpreb2P13373 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Vpreb2P13373 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Vpreb2P13373 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Vpreb2P13373 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Vpreb2P13373 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Vpreb2P13373 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Vpreb2P13373 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Vpreb2P13373 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Vpreb2P13373 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Vpreb2P13373 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Vpreb2P13373 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Vpreb2P13373 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Vpreb2P13373 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Vpreb2P13373 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Vpreb2P13373 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Vpreb2P13373 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Vpreb2P13373 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Vpreb2P13373 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vpreb2P13373 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vpreb2P13373 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vpreb2P13373 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vpreb2P13373 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vpreb2P13373 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vpreb2P13373 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vpreb2P13373 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vpreb2P13373 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vpreb2P13373 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vpreb2P13373 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vpreb2P13373 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vpreb2P13373 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vpreb2P13373 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vpreb2P13373 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vpreb2P13373 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vpreb2P13373 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vpreb2P13373 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Vpreb2P13373 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Vpreb2P13373 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vpreb2P13373 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vpreb2P13373 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Vpreb2P13373 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vpreb2P13373 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vpreb2P13373 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vpreb2P13373 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vpreb2P13373 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vpreb2P13373 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vpreb2P13373 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vpreb2P13373 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vpreb2P13373 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vpreb2P13373 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vpreb2P13373 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vpreb2P13373 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vpreb2P13373 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Vpreb2P13373 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Vpreb2P13373 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Vpreb2P13373 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Vpreb2P13373 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Vpreb2P13373 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Vpreb2P13373 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Vpreb2P13373 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Vpreb2P13373 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Vpreb2P13373 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Vpreb2P13373 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Vpreb2P13373 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Vpreb2P13373 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Vpreb2P13373 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Vpreb2P13373 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Vpreb2P13373 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Vpreb2P13373 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Vpreb2P13373 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Vpreb2P13373 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Vpreb2P13373 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Vpreb2P13373 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Vpreb2P13373 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Vpreb2P13373 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Vpreb2P13373 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Vpreb2P13373 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Vpreb2P13373 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Vpreb2P13373 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Vpreb2P13373 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Vpreb2P13373 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Vpreb2P13373 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Vpreb2P13373 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Vpreb2P13373 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Vpreb2P13373 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Vpreb2P13373 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Vpreb2P13373 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vpreb2P13373 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vpreb2P13373 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms