Protein–RNA interactions for Protein: P0DP43

Catspere, Cation channel sperm-associated protein subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CatspereP0DP43 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CatspereP0DP43 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CatspereP0DP43 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CatspereP0DP43 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CatspereP0DP43 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CatspereP0DP43 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CatspereP0DP43 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CatspereP0DP43 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CatspereP0DP43 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CatspereP0DP43 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CatspereP0DP43 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CatspereP0DP43 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CatspereP0DP43 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CatspereP0DP43 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CatspereP0DP43 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CatspereP0DP43 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CatspereP0DP43 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CatspereP0DP43 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CatspereP0DP43 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CatspereP0DP43 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CatspereP0DP43 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CatspereP0DP43 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CatspereP0DP43 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CatspereP0DP43 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CatspereP0DP43 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CatspereP0DP43 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CatspereP0DP43 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CatspereP0DP43 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CatspereP0DP43 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CatspereP0DP43 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CatspereP0DP43 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CatspereP0DP43 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CatspereP0DP43 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CatspereP0DP43 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CatspereP0DP43 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CatspereP0DP43 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CatspereP0DP43 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CatspereP0DP43 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CatspereP0DP43 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CatspereP0DP43 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CatspereP0DP43 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CatspereP0DP43 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CatspereP0DP43 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CatspereP0DP43 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CatspereP0DP43 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CatspereP0DP43 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
CatspereP0DP43 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CatspereP0DP43 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CatspereP0DP43 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CatspereP0DP43 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CatspereP0DP43 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CatspereP0DP43 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
CatspereP0DP43 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CatspereP0DP43 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CatspereP0DP43 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CatspereP0DP43 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CatspereP0DP43 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CatspereP0DP43 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CatspereP0DP43 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CatspereP0DP43 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CatspereP0DP43 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CatspereP0DP43 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CatspereP0DP43 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CatspereP0DP43 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CatspereP0DP43 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CatspereP0DP43 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CatspereP0DP43 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CatspereP0DP43 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CatspereP0DP43 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CatspereP0DP43 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CatspereP0DP43 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CatspereP0DP43 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CatspereP0DP43 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CatspereP0DP43 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CatspereP0DP43 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CatspereP0DP43 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CatspereP0DP43 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CatspereP0DP43 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CatspereP0DP43 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CatspereP0DP43 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
CatspereP0DP43 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CatspereP0DP43 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CatspereP0DP43 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CatspereP0DP43 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CatspereP0DP43 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
CatspereP0DP43 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CatspereP0DP43 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
CatspereP0DP43 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CatspereP0DP43 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CatspereP0DP43 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CatspereP0DP43 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CatspereP0DP43 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CatspereP0DP43 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CatspereP0DP43 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CatspereP0DP43 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CatspereP0DP43 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
CatspereP0DP43 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
CatspereP0DP43 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CatspereP0DP43 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
CatspereP0DP43 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms