Protein–RNA interactions for Protein: P09174

Pde6g, Retinal rod rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit gamma, mousemouse

Predictions only

Length 87 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6gP09174 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pde6gP09174 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pde6gP09174 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pde6gP09174 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pde6gP09174 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pde6gP09174 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pde6gP09174 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pde6gP09174 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pde6gP09174 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pde6gP09174 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pde6gP09174 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pde6gP09174 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pde6gP09174 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pde6gP09174 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pde6gP09174 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pde6gP09174 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pde6gP09174 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pde6gP09174 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pde6gP09174 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pde6gP09174 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pde6gP09174 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pde6gP09174 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pde6gP09174 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pde6gP09174 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pde6gP09174 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pde6gP09174 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pde6gP09174 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pde6gP09174 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pde6gP09174 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pde6gP09174 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pde6gP09174 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pde6gP09174 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pde6gP09174 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pde6gP09174 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pde6gP09174 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pde6gP09174 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Pde6gP09174 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pde6gP09174 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pde6gP09174 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pde6gP09174 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pde6gP09174 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pde6gP09174 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pde6gP09174 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Pde6gP09174 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Pde6gP09174 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pde6gP09174 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Pde6gP09174 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Pde6gP09174 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pde6gP09174 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pde6gP09174 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pde6gP09174 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pde6gP09174 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pde6gP09174 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pde6gP09174 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pde6gP09174 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pde6gP09174 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pde6gP09174 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pde6gP09174 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pde6gP09174 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pde6gP09174 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pde6gP09174 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pde6gP09174 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pde6gP09174 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pde6gP09174 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Pde6gP09174 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
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Pde6gP09174 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pde6gP09174 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pde6gP09174 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pde6gP09174 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pde6gP09174 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pde6gP09174 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pde6gP09174 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pde6gP09174 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pde6gP09174 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pde6gP09174 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pde6gP09174 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pde6gP09174 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Pde6gP09174 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pde6gP09174 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pde6gP09174 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pde6gP09174 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pde6gP09174 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pde6gP09174 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Pde6gP09174 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pde6gP09174 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pde6gP09174 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pde6gP09174 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pde6gP09174 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pde6gP09174 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pde6gP09174 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Pde6gP09174 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Pde6gP09174 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Pde6gP09174 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Pde6gP09174 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Pde6gP09174 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Pde6gP09174 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Pde6gP09174 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Pde6gP09174 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Pde6gP09174 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
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