Protein–RNA interactions for Protein: P08122

Col4a2, Collagen alpha-2(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,707 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a2P08122 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col4a2P08122 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Col4a2P08122 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Col4a2P08122 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Col4a2P08122 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Col4a2P08122 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Col4a2P08122 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Col4a2P08122 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Col4a2P08122 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Col4a2P08122 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Col4a2P08122 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Col4a2P08122 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Col4a2P08122 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Col4a2P08122 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Col4a2P08122 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Col4a2P08122 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Col4a2P08122 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Col4a2P08122 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Col4a2P08122 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Col4a2P08122 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Col4a2P08122 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Col4a2P08122 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Col4a2P08122 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Col4a2P08122 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Col4a2P08122 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Col4a2P08122 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Col4a2P08122 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Col4a2P08122 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Col4a2P08122 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Col4a2P08122 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Col4a2P08122 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Col4a2P08122 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Col4a2P08122 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Col4a2P08122 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Col4a2P08122 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Col4a2P08122 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Col4a2P08122 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Col4a2P08122 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Col4a2P08122 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Col4a2P08122 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Col4a2P08122 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Col4a2P08122 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Col4a2P08122 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Col4a2P08122 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Col4a2P08122 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Col4a2P08122 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Col4a2P08122 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Col4a2P08122 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Col4a2P08122 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Col4a2P08122 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Col4a2P08122 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Col4a2P08122 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Col4a2P08122 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Col4a2P08122 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Col4a2P08122 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Col4a2P08122 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Col4a2P08122 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Col4a2P08122 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Col4a2P08122 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Col4a2P08122 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Col4a2P08122 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Col4a2P08122 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Col4a2P08122 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Col4a2P08122 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Col4a2P08122 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Col4a2P08122 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Col4a2P08122 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Col4a2P08122 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Col4a2P08122 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Col4a2P08122 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Col4a2P08122 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Col4a2P08122 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Col4a2P08122 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Col4a2P08122 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Col4a2P08122 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Col4a2P08122 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Col4a2P08122 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Col4a2P08122 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Col4a2P08122 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Col4a2P08122 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Col4a2P08122 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Col4a2P08122 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Col4a2P08122 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Col4a2P08122 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Col4a2P08122 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Col4a2P08122 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Col4a2P08122 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Col4a2P08122 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Col4a2P08122 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Col4a2P08122 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Col4a2P08122 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Col4a2P08122 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Col4a2P08122 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Col4a2P08122 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Col4a2P08122 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Col4a2P08122 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Col4a2P08122 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Col4a2P08122 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Col4a2P08122 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Col4a2P08122 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms