Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
H2-Eb1P04230 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
H2-Eb1P04230 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2-Eb1P04230 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2-Eb1P04230 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2-Eb1P04230 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2-Eb1P04230 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2-Eb1P04230 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2-Eb1P04230 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2-Eb1P04230 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2-Eb1P04230 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2-Eb1P04230 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2-Eb1P04230 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
H2-Eb1P04230 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2-Eb1P04230 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2-Eb1P04230 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
H2-Eb1P04230 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2-Eb1P04230 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2-Eb1P04230 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2-Eb1P04230 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2-Eb1P04230 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2-Eb1P04230 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2-Eb1P04230 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2-Eb1P04230 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2-Eb1P04230 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
H2-Eb1P04230 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2-Eb1P04230 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2-Eb1P04230 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2-Eb1P04230 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2-Eb1P04230 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2-Eb1P04230 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2-Eb1P04230 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2-Eb1P04230 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2-Eb1P04230 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2-Eb1P04230 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2-Eb1P04230 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2-Eb1P04230 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2-Eb1P04230 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2-Eb1P04230 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2-Eb1P04230 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2-Eb1P04230 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
H2-Eb1P04230 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2-Eb1P04230 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2-Eb1P04230 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2-Eb1P04230 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2-Eb1P04230 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2-Eb1P04230 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2-Eb1P04230 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2-Eb1P04230 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2-Eb1P04230 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2-Eb1P04230 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
H2-Eb1P04230 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2-Eb1P04230 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2-Eb1P04230 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2-Eb1P04230 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2-Eb1P04230 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2-Eb1P04230 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2-Eb1P04230 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2-Eb1P04230 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2-Eb1P04230 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2-Eb1P04230 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2-Eb1P04230 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2-Eb1P04230 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2-Eb1P04230 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2-Eb1P04230 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2-Eb1P04230 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2-Eb1P04230 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2-Eb1P04230 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
H2-Eb1P04230 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
H2-Eb1P04230 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
H2-Eb1P04230 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2-Eb1P04230 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2-Eb1P04230 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2-Eb1P04230 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2-Eb1P04230 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2-Eb1P04230 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
H2-Eb1P04230 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
H2-Eb1P04230 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2-Eb1P04230 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2-Eb1P04230 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2-Eb1P04230 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2-Eb1P04230 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2-Eb1P04230 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2-Eb1P04230 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2-Eb1P04230 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2-Eb1P04230 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2-Eb1P04230 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2-Eb1P04230 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2-Eb1P04230 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2-Eb1P04230 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2-Eb1P04230 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2-Eb1P04230 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2-Eb1P04230 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2-Eb1P04230 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2-Eb1P04230 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2-Eb1P04230 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2-Eb1P04230 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2-Eb1P04230 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2-Eb1P04230 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2-Eb1P04230 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms