Protein–RNA interactions for Protein: P01679

Ig kappa chain V-VI region J539, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01679 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01679 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
P01679 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01679 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01679 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
P01679 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01679 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01679 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01679 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01679 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01679 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01679 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01679 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01679 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01679 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01679 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01679 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01679 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01679 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01679 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01679 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01679 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01679 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01679 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01679 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01679 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
P01679 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01679 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01679 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01679 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01679 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01679 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01679 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01679 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01679 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01679 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01679 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01679 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
P01679 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01679 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01679 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01679 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01679 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01679 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01679 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01679 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01679 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01679 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01679 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01679 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01679 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01679 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01679 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01679 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01679 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01679 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01679 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01679 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01679 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01679 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01679 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01679 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01679 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01679 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01679 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01679 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01679 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01679 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01679 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01679 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01679 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01679 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01679 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01679 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01679 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01679 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01679 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01679 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01679 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
P01679 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01679 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01679 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
P01679 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01679 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01679 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01679 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01679 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01679 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01679 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01679 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01679 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01679 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01679 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01679 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01679 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01679 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01679 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01679 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01679 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01679 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms