Protein–RNA interactions for Protein: P01669

Ig kappa chain V-III region PC 7769, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01669 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01669 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01669 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01669 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01669 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01669 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01669 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01669 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
P01669 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
P01669 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01669 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
P01669 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01669 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01669 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01669 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
P01669 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01669 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01669 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01669 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01669 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01669 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01669 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01669 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01669 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01669 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01669 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01669 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01669 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01669 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01669 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01669 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01669 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01669 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01669 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
P01669 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01669 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
P01669 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
P01669 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
P01669 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
P01669 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
P01669 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01669 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01669 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01669 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01669 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01669 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01669 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01669 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01669 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01669 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01669 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01669 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01669 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01669 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01669 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01669 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01669 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01669 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01669 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01669 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01669 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01669 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01669 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01669 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01669 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01669 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01669 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
P01669 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01669 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01669 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01669 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01669 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01669 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01669 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01669 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01669 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01669 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01669 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01669 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01669 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01669 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01669 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01669 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01669 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01669 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01669 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01669 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01669 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01669 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01669 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01669 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01669 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01669 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01669 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01669 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01669 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01669 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01669 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01669 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01669 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms