Protein–RNA interactions for Protein: P01635

Ig kappa chain V-V region K2 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01635 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01635 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01635 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01635 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01635 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01635 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01635 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01635 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01635 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01635 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01635 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01635 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
P01635 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01635 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01635 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01635 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01635 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01635 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01635 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01635 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01635 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01635 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01635 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01635 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
P01635 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
P01635 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
P01635 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
P01635 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
P01635 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01635 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01635 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01635 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01635 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01635 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
P01635 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
P01635 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
P01635 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01635 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01635 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01635 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01635 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01635 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01635 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01635 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01635 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01635 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01635 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01635 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01635 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01635 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01635 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01635 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01635 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01635 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01635 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01635 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01635 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01635 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01635 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01635 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
P01635 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01635 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01635 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01635 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01635 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01635 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01635 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01635 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01635 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01635 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01635 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01635 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01635 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01635 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01635 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01635 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01635 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01635 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01635 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01635 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01635 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01635 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01635 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01635 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01635 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01635 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01635 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01635 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01635 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01635 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01635 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01635 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
P01635 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01635 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01635 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01635 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01635 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01635 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01635 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01635 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms