Protein–RNA interactions for Protein: P01634

Ig kappa chain V-V region MOPC 21, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01634 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01634 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
P01634 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
P01634 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01634 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01634 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01634 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01634 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01634 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01634 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
P01634 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01634 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
P01634 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.06■□□□□ 0
P01634 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.06■□□□□ 0
P01634 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01634 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01634 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
P01634 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01634 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.06■□□□□ 0
P01634 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01634 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01634 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01634 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01634 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01634 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01634 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01634 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
P01634 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
P01634 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
P01634 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
P01634 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
P01634 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
P01634 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
P01634 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01634 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01634 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.05■□□□□ -0
P01634 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01634 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01634 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01634 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01634 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01634 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01634 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01634 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01634 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01634 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01634 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01634 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01634 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01634 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01634 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01634 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01634 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
P01634 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
P01634 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01634 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.04■□□□□ -0
P01634 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01634 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01634 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
P01634 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01634 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
P01634 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01634 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01634 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
P01634 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01634 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01634 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01634 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
P01634 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01634 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01634 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
P01634 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01634 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01634 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01634 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01634 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.03■□□□□ -0
P01634 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
P01634 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01634 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
P01634 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01634 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
P01634 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.03■□□□□ -0
P01634 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01634 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01634 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01634 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01634 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
P01634 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01634 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
P01634 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01634 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01634 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
P01634 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
P01634 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01634 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01634 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
P01634 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
P01634 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
P01634 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
P01634 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms