Protein–RNA interactions for Protein: O88703

Hcn2, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 2, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hcn2O88703 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hcn2O88703 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hcn2O88703 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hcn2O88703 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hcn2O88703 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hcn2O88703 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hcn2O88703 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hcn2O88703 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hcn2O88703 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hcn2O88703 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hcn2O88703 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hcn2O88703 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hcn2O88703 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hcn2O88703 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hcn2O88703 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hcn2O88703 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hcn2O88703 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hcn2O88703 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hcn2O88703 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hcn2O88703 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hcn2O88703 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hcn2O88703 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hcn2O88703 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hcn2O88703 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hcn2O88703 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hcn2O88703 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hcn2O88703 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hcn2O88703 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hcn2O88703 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hcn2O88703 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hcn2O88703 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hcn2O88703 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hcn2O88703 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Hcn2O88703 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Hcn2O88703 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Hcn2O88703 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Hcn2O88703 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Hcn2O88703 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hcn2O88703 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hcn2O88703 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hcn2O88703 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hcn2O88703 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hcn2O88703 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hcn2O88703 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hcn2O88703 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hcn2O88703 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hcn2O88703 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hcn2O88703 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hcn2O88703 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hcn2O88703 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hcn2O88703 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hcn2O88703 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hcn2O88703 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hcn2O88703 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hcn2O88703 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hcn2O88703 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hcn2O88703 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hcn2O88703 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hcn2O88703 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hcn2O88703 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Hcn2O88703 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hcn2O88703 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hcn2O88703 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hcn2O88703 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hcn2O88703 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hcn2O88703 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hcn2O88703 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hcn2O88703 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hcn2O88703 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hcn2O88703 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hcn2O88703 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hcn2O88703 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hcn2O88703 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hcn2O88703 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hcn2O88703 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hcn2O88703 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hcn2O88703 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hcn2O88703 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hcn2O88703 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hcn2O88703 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hcn2O88703 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hcn2O88703 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hcn2O88703 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hcn2O88703 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hcn2O88703 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hcn2O88703 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hcn2O88703 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hcn2O88703 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hcn2O88703 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hcn2O88703 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hcn2O88703 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hcn2O88703 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hcn2O88703 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hcn2O88703 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hcn2O88703 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hcn2O88703 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hcn2O88703 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hcn2O88703 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hcn2O88703 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hcn2O88703 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms