Protein–RNA interactions for Protein: O70263

Lnx1, E3 ubiquitin-protein ligase LNX, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lnx1O70263 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Lnx1O70263 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Lnx1O70263 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lnx1O70263 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lnx1O70263 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lnx1O70263 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lnx1O70263 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lnx1O70263 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Lnx1O70263 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lnx1O70263 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lnx1O70263 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lnx1O70263 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Lnx1O70263 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Lnx1O70263 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Lnx1O70263 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Lnx1O70263 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Lnx1O70263 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Lnx1O70263 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Lnx1O70263 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Lnx1O70263 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Lnx1O70263 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Lnx1O70263 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Lnx1O70263 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Lnx1O70263 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Lnx1O70263 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Lnx1O70263 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Lnx1O70263 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Lnx1O70263 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Lnx1O70263 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Lnx1O70263 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Lnx1O70263 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Lnx1O70263 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Lnx1O70263 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Lnx1O70263 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Lnx1O70263 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Lnx1O70263 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Lnx1O70263 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Lnx1O70263 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Lnx1O70263 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Lnx1O70263 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Lnx1O70263 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Lnx1O70263 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Lnx1O70263 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Lnx1O70263 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Lnx1O70263 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Lnx1O70263 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Lnx1O70263 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Lnx1O70263 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Lnx1O70263 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Lnx1O70263 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lnx1O70263 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lnx1O70263 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lnx1O70263 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lnx1O70263 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lnx1O70263 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lnx1O70263 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lnx1O70263 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lnx1O70263 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Lnx1O70263 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lnx1O70263 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lnx1O70263 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lnx1O70263 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lnx1O70263 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lnx1O70263 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lnx1O70263 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lnx1O70263 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lnx1O70263 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lnx1O70263 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lnx1O70263 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lnx1O70263 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lnx1O70263 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Lnx1O70263 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lnx1O70263 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lnx1O70263 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lnx1O70263 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lnx1O70263 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lnx1O70263 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lnx1O70263 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lnx1O70263 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lnx1O70263 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lnx1O70263 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lnx1O70263 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lnx1O70263 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lnx1O70263 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Lnx1O70263 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lnx1O70263 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lnx1O70263 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lnx1O70263 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lnx1O70263 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lnx1O70263 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Lnx1O70263 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lnx1O70263 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lnx1O70263 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lnx1O70263 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lnx1O70263 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lnx1O70263 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lnx1O70263 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lnx1O70263 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lnx1O70263 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lnx1O70263 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.4 ms