Protein–RNA interactions for Protein: O55013

Trappc3, Trafficking protein particle complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc3O55013 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trappc3O55013 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trappc3O55013 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trappc3O55013 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trappc3O55013 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trappc3O55013 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trappc3O55013 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trappc3O55013 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trappc3O55013 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trappc3O55013 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trappc3O55013 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trappc3O55013 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trappc3O55013 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trappc3O55013 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trappc3O55013 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trappc3O55013 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trappc3O55013 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trappc3O55013 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trappc3O55013 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trappc3O55013 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Trappc3O55013 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Trappc3O55013 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Trappc3O55013 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Trappc3O55013 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Trappc3O55013 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Trappc3O55013 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Trappc3O55013 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trappc3O55013 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trappc3O55013 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trappc3O55013 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trappc3O55013 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trappc3O55013 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trappc3O55013 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trappc3O55013 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trappc3O55013 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trappc3O55013 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trappc3O55013 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trappc3O55013 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trappc3O55013 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trappc3O55013 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trappc3O55013 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trappc3O55013 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Trappc3O55013 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trappc3O55013 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trappc3O55013 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trappc3O55013 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trappc3O55013 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trappc3O55013 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trappc3O55013 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trappc3O55013 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trappc3O55013 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trappc3O55013 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Trappc3O55013 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trappc3O55013 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trappc3O55013 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trappc3O55013 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trappc3O55013 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trappc3O55013 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trappc3O55013 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Trappc3O55013 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trappc3O55013 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trappc3O55013 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trappc3O55013 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trappc3O55013 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trappc3O55013 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trappc3O55013 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trappc3O55013 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trappc3O55013 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trappc3O55013 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trappc3O55013 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trappc3O55013 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trappc3O55013 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trappc3O55013 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trappc3O55013 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trappc3O55013 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trappc3O55013 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trappc3O55013 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Trappc3O55013 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trappc3O55013 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trappc3O55013 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trappc3O55013 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trappc3O55013 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trappc3O55013 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trappc3O55013 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trappc3O55013 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trappc3O55013 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trappc3O55013 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trappc3O55013 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trappc3O55013 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trappc3O55013 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trappc3O55013 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Trappc3O55013 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trappc3O55013 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trappc3O55013 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trappc3O55013 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trappc3O55013 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trappc3O55013 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trappc3O55013 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trappc3O55013 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trappc3O55013 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms