Protein–RNA interactions for Protein: O35943

Fxn, Frataxin, mitochondrial, mousemouse

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Length 207 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FxnO35943 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FxnO35943 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FxnO35943 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FxnO35943 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FxnO35943 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FxnO35943 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FxnO35943 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FxnO35943 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FxnO35943 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FxnO35943 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FxnO35943 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FxnO35943 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FxnO35943 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FxnO35943 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FxnO35943 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FxnO35943 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FxnO35943 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FxnO35943 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FxnO35943 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FxnO35943 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FxnO35943 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FxnO35943 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
FxnO35943 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FxnO35943 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FxnO35943 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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FxnO35943 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FxnO35943 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FxnO35943 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FxnO35943 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FxnO35943 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FxnO35943 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FxnO35943 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FxnO35943 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FxnO35943 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FxnO35943 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FxnO35943 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
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FxnO35943 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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FxnO35943 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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FxnO35943 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FxnO35943 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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FxnO35943 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FxnO35943 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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FxnO35943 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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FxnO35943 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FxnO35943 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FxnO35943 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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FxnO35943 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FxnO35943 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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