Protein–RNA interactions for Protein: O35714

Tnfrsf18, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 18, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf18O35714 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tnfrsf18O35714 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tnfrsf18O35714 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tnfrsf18O35714 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tnfrsf18O35714 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tnfrsf18O35714 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tnfrsf18O35714 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tnfrsf18O35714 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tnfrsf18O35714 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Tnfrsf18O35714 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tnfrsf18O35714 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tnfrsf18O35714 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tnfrsf18O35714 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tnfrsf18O35714 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tnfrsf18O35714 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tnfrsf18O35714 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tnfrsf18O35714 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tnfrsf18O35714 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tnfrsf18O35714 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tnfrsf18O35714 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tnfrsf18O35714 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tnfrsf18O35714 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tnfrsf18O35714 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tnfrsf18O35714 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tnfrsf18O35714 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Tnfrsf18O35714 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tnfrsf18O35714 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tnfrsf18O35714 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tnfrsf18O35714 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tnfrsf18O35714 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tnfrsf18O35714 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tnfrsf18O35714 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Tnfrsf18O35714 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tnfrsf18O35714 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tnfrsf18O35714 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tnfrsf18O35714 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tnfrsf18O35714 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tnfrsf18O35714 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tnfrsf18O35714 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tnfrsf18O35714 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tnfrsf18O35714 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tnfrsf18O35714 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tnfrsf18O35714 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tnfrsf18O35714 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tnfrsf18O35714 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tnfrsf18O35714 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tnfrsf18O35714 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tnfrsf18O35714 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tnfrsf18O35714 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tnfrsf18O35714 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tnfrsf18O35714 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tnfrsf18O35714 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tnfrsf18O35714 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tnfrsf18O35714 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tnfrsf18O35714 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tnfrsf18O35714 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tnfrsf18O35714 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Tnfrsf18O35714 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tnfrsf18O35714 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tnfrsf18O35714 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tnfrsf18O35714 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tnfrsf18O35714 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Tnfrsf18O35714 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tnfrsf18O35714 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tnfrsf18O35714 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tnfrsf18O35714 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tnfrsf18O35714 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tnfrsf18O35714 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tnfrsf18O35714 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tnfrsf18O35714 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tnfrsf18O35714 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tnfrsf18O35714 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tnfrsf18O35714 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tnfrsf18O35714 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tnfrsf18O35714 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tnfrsf18O35714 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tnfrsf18O35714 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tnfrsf18O35714 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tnfrsf18O35714 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tnfrsf18O35714 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tnfrsf18O35714 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tnfrsf18O35714 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tnfrsf18O35714 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tnfrsf18O35714 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tnfrsf18O35714 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tnfrsf18O35714 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tnfrsf18O35714 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Tnfrsf18O35714 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tnfrsf18O35714 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tnfrsf18O35714 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tnfrsf18O35714 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tnfrsf18O35714 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tnfrsf18O35714 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tnfrsf18O35714 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tnfrsf18O35714 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tnfrsf18O35714 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tnfrsf18O35714 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tnfrsf18O35714 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tnfrsf18O35714 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tnfrsf18O35714 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms