Protein–RNA interactions for Protein: O35473

C1d, Nuclear nucleic acid-binding protein C1D, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1dO35473 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C1dO35473 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C1dO35473 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C1dO35473 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C1dO35473 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C1dO35473 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C1dO35473 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C1dO35473 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
C1dO35473 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C1dO35473 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C1dO35473 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C1dO35473 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C1dO35473 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
C1dO35473 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C1dO35473 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C1dO35473 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C1dO35473 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C1dO35473 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C1dO35473 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C1dO35473 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
C1dO35473 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C1dO35473 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C1dO35473 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C1dO35473 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C1dO35473 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C1dO35473 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C1dO35473 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C1dO35473 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C1dO35473 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C1dO35473 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C1dO35473 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C1dO35473 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C1dO35473 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C1dO35473 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C1dO35473 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C1dO35473 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C1dO35473 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C1dO35473 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C1dO35473 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C1dO35473 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C1dO35473 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
C1dO35473 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C1dO35473 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C1dO35473 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C1dO35473 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C1dO35473 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
C1dO35473 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C1dO35473 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C1dO35473 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C1dO35473 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C1dO35473 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C1dO35473 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C1dO35473 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C1dO35473 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C1dO35473 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C1dO35473 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C1dO35473 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
C1dO35473 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C1dO35473 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C1dO35473 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C1dO35473 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C1dO35473 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C1dO35473 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C1dO35473 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C1dO35473 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C1dO35473 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C1dO35473 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
C1dO35473 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C1dO35473 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C1dO35473 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C1dO35473 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C1dO35473 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C1dO35473 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C1dO35473 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C1dO35473 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C1dO35473 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C1dO35473 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C1dO35473 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C1dO35473 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C1dO35473 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C1dO35473 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C1dO35473 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C1dO35473 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C1dO35473 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C1dO35473 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C1dO35473 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C1dO35473 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C1dO35473 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C1dO35473 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C1dO35473 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C1dO35473 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C1dO35473 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C1dO35473 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C1dO35473 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C1dO35473 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C1dO35473 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C1dO35473 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C1dO35473 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C1dO35473 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C1dO35473 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms