Protein–RNA interactions for Protein: O35452

Tnxb, Tenascin X, mousemouse

Predictions only

Length 4,006 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnxbO35452 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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TnxbO35452 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
TnxbO35452 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
TnxbO35452 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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TnxbO35452 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
TnxbO35452 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
TnxbO35452 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
TnxbO35452 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
TnxbO35452 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
TnxbO35452 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
TnxbO35452 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
TnxbO35452 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
TnxbO35452 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
TnxbO35452 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
TnxbO35452 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
TnxbO35452 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
TnxbO35452 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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