Protein–RNA interactions for Protein: O35367

Kera, Keratocan, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KeraO35367 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KeraO35367 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KeraO35367 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KeraO35367 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KeraO35367 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KeraO35367 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KeraO35367 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
KeraO35367 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KeraO35367 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KeraO35367 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KeraO35367 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KeraO35367 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KeraO35367 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KeraO35367 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KeraO35367 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KeraO35367 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KeraO35367 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KeraO35367 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KeraO35367 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KeraO35367 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KeraO35367 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KeraO35367 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KeraO35367 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KeraO35367 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KeraO35367 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KeraO35367 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KeraO35367 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KeraO35367 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KeraO35367 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KeraO35367 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KeraO35367 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KeraO35367 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
KeraO35367 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KeraO35367 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KeraO35367 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KeraO35367 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KeraO35367 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KeraO35367 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KeraO35367 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KeraO35367 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KeraO35367 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KeraO35367 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KeraO35367 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KeraO35367 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KeraO35367 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
KeraO35367 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
KeraO35367 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
KeraO35367 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
KeraO35367 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
KeraO35367 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
KeraO35367 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
KeraO35367 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
KeraO35367 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
KeraO35367 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
KeraO35367 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
KeraO35367 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
KeraO35367 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
KeraO35367 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
KeraO35367 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
KeraO35367 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
KeraO35367 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
KeraO35367 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
KeraO35367 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
KeraO35367 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
KeraO35367 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
KeraO35367 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
KeraO35367 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
KeraO35367 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
KeraO35367 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
KeraO35367 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
KeraO35367 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
KeraO35367 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
KeraO35367 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
KeraO35367 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
KeraO35367 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
KeraO35367 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
KeraO35367 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
KeraO35367 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
KeraO35367 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
KeraO35367 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
KeraO35367 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
KeraO35367 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
KeraO35367 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
KeraO35367 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
KeraO35367 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
KeraO35367 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
KeraO35367 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
KeraO35367 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
KeraO35367 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
KeraO35367 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
KeraO35367 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
KeraO35367 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
KeraO35367 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
KeraO35367 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
KeraO35367 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
KeraO35367 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
KeraO35367 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KeraO35367 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KeraO35367 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KeraO35367 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms