Protein–RNA interactions for Protein: O35324

Sh2d1b, SH2 domain-containing protein 1B, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh2d1bO35324 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sh2d1bO35324 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sh2d1bO35324 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sh2d1bO35324 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sh2d1bO35324 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sh2d1bO35324 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sh2d1bO35324 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sh2d1bO35324 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Sh2d1bO35324 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sh2d1bO35324 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sh2d1bO35324 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sh2d1bO35324 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Sh2d1bO35324 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sh2d1bO35324 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sh2d1bO35324 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sh2d1bO35324 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sh2d1bO35324 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sh2d1bO35324 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sh2d1bO35324 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sh2d1bO35324 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sh2d1bO35324 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sh2d1bO35324 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sh2d1bO35324 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sh2d1bO35324 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sh2d1bO35324 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sh2d1bO35324 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sh2d1bO35324 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sh2d1bO35324 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Sh2d1bO35324 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Sh2d1bO35324 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sh2d1bO35324 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Sh2d1bO35324 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Sh2d1bO35324 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sh2d1bO35324 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sh2d1bO35324 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sh2d1bO35324 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sh2d1bO35324 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sh2d1bO35324 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sh2d1bO35324 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sh2d1bO35324 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sh2d1bO35324 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sh2d1bO35324 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sh2d1bO35324 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sh2d1bO35324 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sh2d1bO35324 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sh2d1bO35324 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sh2d1bO35324 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sh2d1bO35324 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sh2d1bO35324 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sh2d1bO35324 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sh2d1bO35324 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sh2d1bO35324 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sh2d1bO35324 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sh2d1bO35324 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sh2d1bO35324 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sh2d1bO35324 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sh2d1bO35324 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sh2d1bO35324 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sh2d1bO35324 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Sh2d1bO35324 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sh2d1bO35324 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sh2d1bO35324 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Sh2d1bO35324 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sh2d1bO35324 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sh2d1bO35324 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sh2d1bO35324 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sh2d1bO35324 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sh2d1bO35324 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sh2d1bO35324 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sh2d1bO35324 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sh2d1bO35324 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sh2d1bO35324 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sh2d1bO35324 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sh2d1bO35324 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sh2d1bO35324 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sh2d1bO35324 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sh2d1bO35324 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sh2d1bO35324 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sh2d1bO35324 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Sh2d1bO35324 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Sh2d1bO35324 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sh2d1bO35324 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Sh2d1bO35324 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Sh2d1bO35324 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sh2d1bO35324 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sh2d1bO35324 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sh2d1bO35324 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sh2d1bO35324 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sh2d1bO35324 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Sh2d1bO35324 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sh2d1bO35324 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sh2d1bO35324 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sh2d1bO35324 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sh2d1bO35324 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sh2d1bO35324 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Sh2d1bO35324 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sh2d1bO35324 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sh2d1bO35324 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sh2d1bO35324 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sh2d1bO35324 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms