Protein–RNA interactions for Protein: O35177

Nedd9, Enhancer of filamentation 1, mousemouse

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd9O35177 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nedd9O35177 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nedd9O35177 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nedd9O35177 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nedd9O35177 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nedd9O35177 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nedd9O35177 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nedd9O35177 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Nedd9O35177 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Nedd9O35177 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nedd9O35177 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nedd9O35177 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nedd9O35177 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nedd9O35177 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nedd9O35177 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nedd9O35177 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nedd9O35177 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nedd9O35177 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nedd9O35177 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nedd9O35177 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nedd9O35177 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Nedd9O35177 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nedd9O35177 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nedd9O35177 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nedd9O35177 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nedd9O35177 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nedd9O35177 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nedd9O35177 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nedd9O35177 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nedd9O35177 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nedd9O35177 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nedd9O35177 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Nedd9O35177 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nedd9O35177 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nedd9O35177 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nedd9O35177 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nedd9O35177 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nedd9O35177 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nedd9O35177 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nedd9O35177 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nedd9O35177 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nedd9O35177 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Nedd9O35177 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nedd9O35177 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nedd9O35177 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nedd9O35177 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nedd9O35177 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nedd9O35177 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nedd9O35177 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nedd9O35177 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nedd9O35177 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nedd9O35177 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nedd9O35177 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
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Nedd9O35177 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nedd9O35177 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nedd9O35177 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Nedd9O35177 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nedd9O35177 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nedd9O35177 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nedd9O35177 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
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Nedd9O35177 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nedd9O35177 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nedd9O35177 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nedd9O35177 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nedd9O35177 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
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Nedd9O35177 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
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Nedd9O35177 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
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Nedd9O35177 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nedd9O35177 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nedd9O35177 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nedd9O35177 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nedd9O35177 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nedd9O35177 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nedd9O35177 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nedd9O35177 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nedd9O35177 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Nedd9O35177 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nedd9O35177 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nedd9O35177 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nedd9O35177 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Nedd9O35177 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nedd9O35177 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nedd9O35177 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nedd9O35177 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Nedd9O35177 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nedd9O35177 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nedd9O35177 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Nedd9O35177 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Nedd9O35177 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nedd9O35177 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nedd9O35177 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nedd9O35177 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nedd9O35177 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nedd9O35177 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nedd9O35177 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
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