Protein–RNA interactions for Protein: O35114

Scarb2, Lysosome membrane protein 2, mousemouse

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Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarb2O35114 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scarb2O35114 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scarb2O35114 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scarb2O35114 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scarb2O35114 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scarb2O35114 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scarb2O35114 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scarb2O35114 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scarb2O35114 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scarb2O35114 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scarb2O35114 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scarb2O35114 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scarb2O35114 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scarb2O35114 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scarb2O35114 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scarb2O35114 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scarb2O35114 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scarb2O35114 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scarb2O35114 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scarb2O35114 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scarb2O35114 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scarb2O35114 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scarb2O35114 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scarb2O35114 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scarb2O35114 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scarb2O35114 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scarb2O35114 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scarb2O35114 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scarb2O35114 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scarb2O35114 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scarb2O35114 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scarb2O35114 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scarb2O35114 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scarb2O35114 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scarb2O35114 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scarb2O35114 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scarb2O35114 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scarb2O35114 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scarb2O35114 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scarb2O35114 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scarb2O35114 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scarb2O35114 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scarb2O35114 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scarb2O35114 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scarb2O35114 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scarb2O35114 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scarb2O35114 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scarb2O35114 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scarb2O35114 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scarb2O35114 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scarb2O35114 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scarb2O35114 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scarb2O35114 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scarb2O35114 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Scarb2O35114 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scarb2O35114 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scarb2O35114 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scarb2O35114 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scarb2O35114 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scarb2O35114 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Scarb2O35114 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scarb2O35114 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scarb2O35114 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Scarb2O35114 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scarb2O35114 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scarb2O35114 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scarb2O35114 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scarb2O35114 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scarb2O35114 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
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Scarb2O35114 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scarb2O35114 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scarb2O35114 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scarb2O35114 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scarb2O35114 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Scarb2O35114 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scarb2O35114 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scarb2O35114 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scarb2O35114 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scarb2O35114 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scarb2O35114 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scarb2O35114 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scarb2O35114 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scarb2O35114 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scarb2O35114 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scarb2O35114 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scarb2O35114 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scarb2O35114 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scarb2O35114 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scarb2O35114 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Scarb2O35114 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scarb2O35114 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scarb2O35114 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scarb2O35114 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Scarb2O35114 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scarb2O35114 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scarb2O35114 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scarb2O35114 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scarb2O35114 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scarb2O35114 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms