Protein–RNA interactions for Protein: O35085

Arx, Homeobox protein ARX, mousemouse

Predictions only

Length 564 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ArxO35085 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ArxO35085 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ArxO35085 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ArxO35085 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ArxO35085 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ArxO35085 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ArxO35085 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
ArxO35085 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ArxO35085 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ArxO35085 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ArxO35085 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ArxO35085 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ArxO35085 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ArxO35085 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ArxO35085 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ArxO35085 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ArxO35085 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ArxO35085 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ArxO35085 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ArxO35085 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ArxO35085 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ArxO35085 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ArxO35085 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ArxO35085 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ArxO35085 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ArxO35085 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
ArxO35085 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ArxO35085 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
ArxO35085 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC21■□□□□ 0.95
ArxO35085 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
ArxO35085 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ArxO35085 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
ArxO35085 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ArxO35085 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ArxO35085 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ArxO35085 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ArxO35085 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ArxO35085 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
ArxO35085 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ArxO35085 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ArxO35085 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ArxO35085 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ArxO35085 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ArxO35085 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ArxO35085 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ArxO35085 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
ArxO35085 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ArxO35085 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ArxO35085 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ArxO35085 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ArxO35085 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ArxO35085 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ArxO35085 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ArxO35085 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ArxO35085 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ArxO35085 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ArxO35085 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ArxO35085 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ArxO35085 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ArxO35085 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ArxO35085 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ArxO35085 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ArxO35085 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ArxO35085 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ArxO35085 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ArxO35085 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ArxO35085 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ArxO35085 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ArxO35085 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ArxO35085 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ArxO35085 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ArxO35085 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ArxO35085 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ArxO35085 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ArxO35085 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ArxO35085 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ArxO35085 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ArxO35085 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ArxO35085 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ArxO35085 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ArxO35085 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ArxO35085 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ArxO35085 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ArxO35085 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ArxO35085 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ArxO35085 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
ArxO35085 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ArxO35085 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ArxO35085 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ArxO35085 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ArxO35085 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
ArxO35085 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ArxO35085 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ArxO35085 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ArxO35085 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ArxO35085 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ArxO35085 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ArxO35085 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ArxO35085 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ArxO35085 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms