Protein–RNA interactions for Protein: O09127

Epha8, Ephrin type-A receptor 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,004 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epha8O09127 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Epha8O09127 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Epha8O09127 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Epha8O09127 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Epha8O09127 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Epha8O09127 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Epha8O09127 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Epha8O09127 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Epha8O09127 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Epha8O09127 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Epha8O09127 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Epha8O09127 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Epha8O09127 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Epha8O09127 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Epha8O09127 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Epha8O09127 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Epha8O09127 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Epha8O09127 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Epha8O09127 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Epha8O09127 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Epha8O09127 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Epha8O09127 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Epha8O09127 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Epha8O09127 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Epha8O09127 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Epha8O09127 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Epha8O09127 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Epha8O09127 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Epha8O09127 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Epha8O09127 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Epha8O09127 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Epha8O09127 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Epha8O09127 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Epha8O09127 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Epha8O09127 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Epha8O09127 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Epha8O09127 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Epha8O09127 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Epha8O09127 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Epha8O09127 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Epha8O09127 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Epha8O09127 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Epha8O09127 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Epha8O09127 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Epha8O09127 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Epha8O09127 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Epha8O09127 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Epha8O09127 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Epha8O09127 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Epha8O09127 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Epha8O09127 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Epha8O09127 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Epha8O09127 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Epha8O09127 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Epha8O09127 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Epha8O09127 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Epha8O09127 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Epha8O09127 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Epha8O09127 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Epha8O09127 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Epha8O09127 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Epha8O09127 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Epha8O09127 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Epha8O09127 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Epha8O09127 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Epha8O09127 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Epha8O09127 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Epha8O09127 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Epha8O09127 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Epha8O09127 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Epha8O09127 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Epha8O09127 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Epha8O09127 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Epha8O09127 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Epha8O09127 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Epha8O09127 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Epha8O09127 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Epha8O09127 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Epha8O09127 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Epha8O09127 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Epha8O09127 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Epha8O09127 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Epha8O09127 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Epha8O09127 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Epha8O09127 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Epha8O09127 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Epha8O09127 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Epha8O09127 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Epha8O09127 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Epha8O09127 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Epha8O09127 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Epha8O09127 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Epha8O09127 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Epha8O09127 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Epha8O09127 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Epha8O09127 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Epha8O09127 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Epha8O09127 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Epha8O09127 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Epha8O09127 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms