Protein–RNA interactions for Protein: O09005

Degs1, Sphingolipid delta(4)-desaturase DES1, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Degs1O09005 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Degs1O09005 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Degs1O09005 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Degs1O09005 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Degs1O09005 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Degs1O09005 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Degs1O09005 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Degs1O09005 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Degs1O09005 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Degs1O09005 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Degs1O09005 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Degs1O09005 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Degs1O09005 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Degs1O09005 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Degs1O09005 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Degs1O09005 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Degs1O09005 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Degs1O09005 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Degs1O09005 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Degs1O09005 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Degs1O09005 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Degs1O09005 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Degs1O09005 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Degs1O09005 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Degs1O09005 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Degs1O09005 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Degs1O09005 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Degs1O09005 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Degs1O09005 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Degs1O09005 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Degs1O09005 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Degs1O09005 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Degs1O09005 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Degs1O09005 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Degs1O09005 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Degs1O09005 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Degs1O09005 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Degs1O09005 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Degs1O09005 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Degs1O09005 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Degs1O09005 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Degs1O09005 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Degs1O09005 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Degs1O09005 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Degs1O09005 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Degs1O09005 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Degs1O09005 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Degs1O09005 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Degs1O09005 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Degs1O09005 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Degs1O09005 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Degs1O09005 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Degs1O09005 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Degs1O09005 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Degs1O09005 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Degs1O09005 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Degs1O09005 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Degs1O09005 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Degs1O09005 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Degs1O09005 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Degs1O09005 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Degs1O09005 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Degs1O09005 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Degs1O09005 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Degs1O09005 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Degs1O09005 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Degs1O09005 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Degs1O09005 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Degs1O09005 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Degs1O09005 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Degs1O09005 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Degs1O09005 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Degs1O09005 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Degs1O09005 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Degs1O09005 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Degs1O09005 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Degs1O09005 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Degs1O09005 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Degs1O09005 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Degs1O09005 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Degs1O09005 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Degs1O09005 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Degs1O09005 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Degs1O09005 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Degs1O09005 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Degs1O09005 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Degs1O09005 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Degs1O09005 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Degs1O09005 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Degs1O09005 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Degs1O09005 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Degs1O09005 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Degs1O09005 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Degs1O09005 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Degs1O09005 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Degs1O09005 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Degs1O09005 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Degs1O09005 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Degs1O09005 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Degs1O09005 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms