Protein–RNA interactions for Protein: O09000

Ncoa3, Nuclear receptor coactivator 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncoa3O09000 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ncoa3O09000 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ncoa3O09000 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ncoa3O09000 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Ncoa3O09000 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ncoa3O09000 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ncoa3O09000 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ncoa3O09000 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ncoa3O09000 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ncoa3O09000 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ncoa3O09000 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ncoa3O09000 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ncoa3O09000 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ncoa3O09000 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ncoa3O09000 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ncoa3O09000 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ncoa3O09000 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ncoa3O09000 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ncoa3O09000 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ncoa3O09000 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ncoa3O09000 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ncoa3O09000 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ncoa3O09000 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ncoa3O09000 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ncoa3O09000 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ncoa3O09000 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ncoa3O09000 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ncoa3O09000 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ncoa3O09000 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ncoa3O09000 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Ncoa3O09000 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ncoa3O09000 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ncoa3O09000 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Ncoa3O09000 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Ncoa3O09000 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ncoa3O09000 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ncoa3O09000 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ncoa3O09000 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ncoa3O09000 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Ncoa3O09000 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Ncoa3O09000 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ncoa3O09000 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ncoa3O09000 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ncoa3O09000 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ncoa3O09000 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ncoa3O09000 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ncoa3O09000 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ncoa3O09000 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ncoa3O09000 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Ncoa3O09000 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Ncoa3O09000 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ncoa3O09000 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ncoa3O09000 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ncoa3O09000 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ncoa3O09000 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ncoa3O09000 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ncoa3O09000 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Ncoa3O09000 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ncoa3O09000 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ncoa3O09000 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ncoa3O09000 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ncoa3O09000 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ncoa3O09000 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ncoa3O09000 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ncoa3O09000 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Ncoa3O09000 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ncoa3O09000 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ncoa3O09000 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ncoa3O09000 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ncoa3O09000 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ncoa3O09000 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ncoa3O09000 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ncoa3O09000 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ncoa3O09000 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ncoa3O09000 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Ncoa3O09000 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ncoa3O09000 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ncoa3O09000 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ncoa3O09000 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ncoa3O09000 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ncoa3O09000 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ncoa3O09000 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ncoa3O09000 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ncoa3O09000 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Ncoa3O09000 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ncoa3O09000 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ncoa3O09000 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ncoa3O09000 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ncoa3O09000 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ncoa3O09000 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ncoa3O09000 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ncoa3O09000 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ncoa3O09000 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ncoa3O09000 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ncoa3O09000 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Ncoa3O09000 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ncoa3O09000 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ncoa3O09000 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ncoa3O09000 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ncoa3O09000 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms