Protein–RNA interactions for Protein: O08810

Eftud2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 971 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eftud2O08810 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Eftud2O08810 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Eftud2O08810 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Eftud2O08810 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Eftud2O08810 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Eftud2O08810 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Eftud2O08810 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Eftud2O08810 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Eftud2O08810 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Eftud2O08810 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Eftud2O08810 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Eftud2O08810 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Eftud2O08810 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Eftud2O08810 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Eftud2O08810 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Eftud2O08810 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Eftud2O08810 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Eftud2O08810 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Eftud2O08810 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Eftud2O08810 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Eftud2O08810 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Eftud2O08810 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Eftud2O08810 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Eftud2O08810 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Eftud2O08810 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Eftud2O08810 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Eftud2O08810 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Eftud2O08810 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Eftud2O08810 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Eftud2O08810 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Eftud2O08810 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Eftud2O08810 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Eftud2O08810 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Eftud2O08810 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Eftud2O08810 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Eftud2O08810 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Eftud2O08810 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Eftud2O08810 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Eftud2O08810 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Eftud2O08810 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Eftud2O08810 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Eftud2O08810 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Eftud2O08810 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Eftud2O08810 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Eftud2O08810 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Eftud2O08810 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Eftud2O08810 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Eftud2O08810 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Eftud2O08810 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Eftud2O08810 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Eftud2O08810 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Eftud2O08810 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Eftud2O08810 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Eftud2O08810 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Eftud2O08810 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Eftud2O08810 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Eftud2O08810 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Eftud2O08810 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Eftud2O08810 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Eftud2O08810 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Eftud2O08810 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Eftud2O08810 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Eftud2O08810 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Eftud2O08810 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Eftud2O08810 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Eftud2O08810 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Eftud2O08810 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Eftud2O08810 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Eftud2O08810 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Eftud2O08810 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Eftud2O08810 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Eftud2O08810 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Eftud2O08810 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Eftud2O08810 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Eftud2O08810 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Eftud2O08810 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Eftud2O08810 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Eftud2O08810 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Eftud2O08810 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Eftud2O08810 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Eftud2O08810 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Eftud2O08810 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Eftud2O08810 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Eftud2O08810 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Eftud2O08810 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Eftud2O08810 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Eftud2O08810 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Eftud2O08810 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Eftud2O08810 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Eftud2O08810 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Eftud2O08810 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Eftud2O08810 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Eftud2O08810 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Eftud2O08810 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Eftud2O08810 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Eftud2O08810 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Eftud2O08810 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Eftud2O08810 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Eftud2O08810 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Eftud2O08810 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms