Protein–RNA interactions for Protein: L7N1W8

Vmn2r88, Vomeronasal 2, receptor 88, mousemouse

Predictions only

Length 857 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn2r88L7N1W8 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn2r88L7N1W8 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn2r88L7N1W8 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn2r88L7N1W8 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn2r88L7N1W8 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn2r88L7N1W8 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn2r88L7N1W8 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn2r88L7N1W8 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn2r88L7N1W8 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn2r88L7N1W8 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn2r88L7N1W8 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn2r88L7N1W8 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn2r88L7N1W8 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn2r88L7N1W8 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn2r88L7N1W8 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn2r88L7N1W8 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn2r88L7N1W8 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn2r88L7N1W8 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn2r88L7N1W8 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn2r88L7N1W8 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn2r88L7N1W8 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn2r88L7N1W8 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn2r88L7N1W8 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn2r88L7N1W8 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn2r88L7N1W8 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn2r88L7N1W8 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn2r88L7N1W8 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn2r88L7N1W8 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn2r88L7N1W8 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn2r88L7N1W8 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn2r88L7N1W8 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn2r88L7N1W8 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn2r88L7N1W8 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn2r88L7N1W8 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn2r88L7N1W8 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Vmn2r88L7N1W8 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Vmn2r88L7N1W8 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Vmn2r88L7N1W8 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn2r88L7N1W8 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn2r88L7N1W8 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn2r88L7N1W8 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn2r88L7N1W8 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn2r88L7N1W8 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn2r88L7N1W8 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn2r88L7N1W8 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn2r88L7N1W8 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn2r88L7N1W8 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn2r88L7N1W8 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn2r88L7N1W8 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn2r88L7N1W8 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn2r88L7N1W8 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn2r88L7N1W8 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn2r88L7N1W8 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn2r88L7N1W8 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn2r88L7N1W8 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn2r88L7N1W8 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn2r88L7N1W8 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn2r88L7N1W8 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn2r88L7N1W8 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn2r88L7N1W8 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn2r88L7N1W8 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn2r88L7N1W8 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn2r88L7N1W8 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn2r88L7N1W8 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn2r88L7N1W8 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn2r88L7N1W8 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn2r88L7N1W8 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn2r88L7N1W8 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn2r88L7N1W8 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn2r88L7N1W8 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn2r88L7N1W8 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn2r88L7N1W8 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn2r88L7N1W8 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn2r88L7N1W8 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn2r88L7N1W8 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn2r88L7N1W8 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn2r88L7N1W8 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn2r88L7N1W8 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn2r88L7N1W8 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn2r88L7N1W8 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn2r88L7N1W8 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn2r88L7N1W8 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn2r88L7N1W8 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn2r88L7N1W8 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn2r88L7N1W8 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn2r88L7N1W8 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn2r88L7N1W8 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn2r88L7N1W8 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn2r88L7N1W8 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn2r88L7N1W8 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn2r88L7N1W8 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn2r88L7N1W8 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn2r88L7N1W8 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn2r88L7N1W8 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn2r88L7N1W8 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn2r88L7N1W8 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn2r88L7N1W8 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn2r88L7N1W8 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn2r88L7N1W8 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn2r88L7N1W8 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms