Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ02

Gm2056, Predicted gene 2056, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2056J3QQ02 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm2056J3QQ02 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm2056J3QQ02 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm2056J3QQ02 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm2056J3QQ02 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm2056J3QQ02 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm2056J3QQ02 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm2056J3QQ02 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm2056J3QQ02 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm2056J3QQ02 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm2056J3QQ02 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm2056J3QQ02 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm2056J3QQ02 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm2056J3QQ02 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm2056J3QQ02 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm2056J3QQ02 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm2056J3QQ02 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm2056J3QQ02 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm2056J3QQ02 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm2056J3QQ02 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm2056J3QQ02 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm2056J3QQ02 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm2056J3QQ02 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm2056J3QQ02 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm2056J3QQ02 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm2056J3QQ02 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm2056J3QQ02 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm2056J3QQ02 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm2056J3QQ02 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm2056J3QQ02 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm2056J3QQ02 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm2056J3QQ02 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm2056J3QQ02 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm2056J3QQ02 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm2056J3QQ02 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm2056J3QQ02 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm2056J3QQ02 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm2056J3QQ02 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm2056J3QQ02 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm2056J3QQ02 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm2056J3QQ02 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm2056J3QQ02 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm2056J3QQ02 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm2056J3QQ02 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm2056J3QQ02 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm2056J3QQ02 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm2056J3QQ02 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm2056J3QQ02 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm2056J3QQ02 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm2056J3QQ02 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm2056J3QQ02 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm2056J3QQ02 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm2056J3QQ02 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm2056J3QQ02 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm2056J3QQ02 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm2056J3QQ02 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm2056J3QQ02 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm2056J3QQ02 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm2056J3QQ02 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm2056J3QQ02 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm2056J3QQ02 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm2056J3QQ02 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm2056J3QQ02 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm2056J3QQ02 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm2056J3QQ02 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm2056J3QQ02 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm2056J3QQ02 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm2056J3QQ02 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm2056J3QQ02 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm2056J3QQ02 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm2056J3QQ02 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm2056J3QQ02 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm2056J3QQ02 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm2056J3QQ02 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm2056J3QQ02 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm2056J3QQ02 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm2056J3QQ02 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm2056J3QQ02 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm2056J3QQ02 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm2056J3QQ02 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm2056J3QQ02 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm2056J3QQ02 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm2056J3QQ02 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm2056J3QQ02 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm2056J3QQ02 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm2056J3QQ02 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm2056J3QQ02 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm2056J3QQ02 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm2056J3QQ02 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm2056J3QQ02 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm2056J3QQ02 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm2056J3QQ02 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm2056J3QQ02 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm2056J3QQ02 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm2056J3QQ02 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm2056J3QQ02 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm2056J3QQ02 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm2056J3QQ02 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm2056J3QQ02 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm2056J3QQ02 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms