Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP2

Smim18, Small integral membrane protein 18, mousemouse

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Length 93 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim18J3QNP2 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Smim18J3QNP2 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Smim18J3QNP2 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Smim18J3QNP2 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Smim18J3QNP2 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Smim18J3QNP2 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Smim18J3QNP2 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Smim18J3QNP2 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Smim18J3QNP2 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Smim18J3QNP2 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Smim18J3QNP2 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Smim18J3QNP2 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Smim18J3QNP2 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Smim18J3QNP2 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Smim18J3QNP2 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Smim18J3QNP2 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Smim18J3QNP2 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Smim18J3QNP2 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Smim18J3QNP2 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Smim18J3QNP2 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Smim18J3QNP2 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Smim18J3QNP2 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Smim18J3QNP2 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Smim18J3QNP2 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Smim18J3QNP2 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Smim18J3QNP2 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Smim18J3QNP2 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Smim18J3QNP2 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Smim18J3QNP2 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Smim18J3QNP2 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Smim18J3QNP2 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Smim18J3QNP2 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Smim18J3QNP2 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Smim18J3QNP2 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Smim18J3QNP2 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Smim18J3QNP2 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Smim18J3QNP2 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Smim18J3QNP2 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Smim18J3QNP2 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Smim18J3QNP2 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Smim18J3QNP2 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Smim18J3QNP2 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Smim18J3QNP2 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Smim18J3QNP2 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Smim18J3QNP2 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Smim18J3QNP2 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Smim18J3QNP2 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Smim18J3QNP2 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Smim18J3QNP2 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Smim18J3QNP2 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Smim18J3QNP2 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Smim18J3QNP2 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Smim18J3QNP2 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Smim18J3QNP2 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Smim18J3QNP2 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Smim18J3QNP2 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Smim18J3QNP2 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Smim18J3QNP2 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Smim18J3QNP2 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Smim18J3QNP2 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Smim18J3QNP2 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Smim18J3QNP2 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Smim18J3QNP2 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Smim18J3QNP2 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Smim18J3QNP2 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Smim18J3QNP2 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Smim18J3QNP2 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Smim18J3QNP2 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Smim18J3QNP2 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Smim18J3QNP2 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Smim18J3QNP2 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Smim18J3QNP2 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Smim18J3QNP2 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Smim18J3QNP2 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Smim18J3QNP2 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Smim18J3QNP2 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Smim18J3QNP2 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Smim18J3QNP2 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Smim18J3QNP2 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Smim18J3QNP2 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Smim18J3QNP2 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Smim18J3QNP2 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Smim18J3QNP2 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Smim18J3QNP2 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Smim18J3QNP2 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Smim18J3QNP2 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Smim18J3QNP2 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Smim18J3QNP2 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Smim18J3QNP2 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Smim18J3QNP2 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Smim18J3QNP2 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Smim18J3QNP2 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Smim18J3QNP2 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Smim18J3QNP2 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Smim18J3QNP2 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Smim18J3QNP2 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Smim18J3QNP2 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Smim18J3QNP2 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Smim18J3QNP2 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Smim18J3QNP2 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
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