Protein–RNA interactions for Protein: J3QMQ6

Gm3336, Predicted gene 3336, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3336J3QMQ6 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gm3336J3QMQ6 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gm3336J3QMQ6 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gm3336J3QMQ6 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gm3336J3QMQ6 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm3336J3QMQ6 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm3336J3QMQ6 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm3336J3QMQ6 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm3336J3QMQ6 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm3336J3QMQ6 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm3336J3QMQ6 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm3336J3QMQ6 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm3336J3QMQ6 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm3336J3QMQ6 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm3336J3QMQ6 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm3336J3QMQ6 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm3336J3QMQ6 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm3336J3QMQ6 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm3336J3QMQ6 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm3336J3QMQ6 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm3336J3QMQ6 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm3336J3QMQ6 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm3336J3QMQ6 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm3336J3QMQ6 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm3336J3QMQ6 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm3336J3QMQ6 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm3336J3QMQ6 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm3336J3QMQ6 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm3336J3QMQ6 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm3336J3QMQ6 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm3336J3QMQ6 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Gm3336J3QMQ6 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm3336J3QMQ6 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm3336J3QMQ6 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Gm3336J3QMQ6 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm3336J3QMQ6 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm3336J3QMQ6 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm3336J3QMQ6 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm3336J3QMQ6 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm3336J3QMQ6 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm3336J3QMQ6 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm3336J3QMQ6 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm3336J3QMQ6 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm3336J3QMQ6 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm3336J3QMQ6 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm3336J3QMQ6 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm3336J3QMQ6 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm3336J3QMQ6 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm3336J3QMQ6 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm3336J3QMQ6 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm3336J3QMQ6 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm3336J3QMQ6 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm3336J3QMQ6 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm3336J3QMQ6 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm3336J3QMQ6 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm3336J3QMQ6 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm3336J3QMQ6 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm3336J3QMQ6 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm3336J3QMQ6 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm3336J3QMQ6 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm3336J3QMQ6 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm3336J3QMQ6 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm3336J3QMQ6 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm3336J3QMQ6 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm3336J3QMQ6 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm3336J3QMQ6 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm3336J3QMQ6 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm3336J3QMQ6 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm3336J3QMQ6 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm3336J3QMQ6 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm3336J3QMQ6 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm3336J3QMQ6 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm3336J3QMQ6 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm3336J3QMQ6 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm3336J3QMQ6 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm3336J3QMQ6 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm3336J3QMQ6 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm3336J3QMQ6 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm3336J3QMQ6 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm3336J3QMQ6 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm3336J3QMQ6 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm3336J3QMQ6 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm3336J3QMQ6 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm3336J3QMQ6 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm3336J3QMQ6 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm3336J3QMQ6 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm3336J3QMQ6 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm3336J3QMQ6 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm3336J3QMQ6 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm3336J3QMQ6 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm3336J3QMQ6 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm3336J3QMQ6 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm3336J3QMQ6 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm3336J3QMQ6 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm3336J3QMQ6 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm3336J3QMQ6 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm3336J3QMQ6 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm3336J3QMQ6 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm3336J3QMQ6 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm3336J3QMQ6 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms