Protein–RNA interactions for Protein: J3QK56

4930544D05Rik, RIKEN cDNA 4930544D05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930544D05RikJ3QK56 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
4930544D05RikJ3QK56 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
4930544D05RikJ3QK56 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
4930544D05RikJ3QK56 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
4930544D05RikJ3QK56 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
4930544D05RikJ3QK56 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
4930544D05RikJ3QK56 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
4930544D05RikJ3QK56 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
4930544D05RikJ3QK56 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
4930544D05RikJ3QK56 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
4930544D05RikJ3QK56 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
4930544D05RikJ3QK56 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
4930544D05RikJ3QK56 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
4930544D05RikJ3QK56 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
4930544D05RikJ3QK56 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
4930544D05RikJ3QK56 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
4930544D05RikJ3QK56 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
4930544D05RikJ3QK56 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
4930544D05RikJ3QK56 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
4930544D05RikJ3QK56 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
4930544D05RikJ3QK56 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
4930544D05RikJ3QK56 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
4930544D05RikJ3QK56 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
4930544D05RikJ3QK56 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
4930544D05RikJ3QK56 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
4930544D05RikJ3QK56 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
4930544D05RikJ3QK56 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
4930544D05RikJ3QK56 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
4930544D05RikJ3QK56 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
4930544D05RikJ3QK56 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
4930544D05RikJ3QK56 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
4930544D05RikJ3QK56 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
4930544D05RikJ3QK56 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
4930544D05RikJ3QK56 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
4930544D05RikJ3QK56 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
4930544D05RikJ3QK56 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
4930544D05RikJ3QK56 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
4930544D05RikJ3QK56 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
4930544D05RikJ3QK56 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
4930544D05RikJ3QK56 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
4930544D05RikJ3QK56 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
4930544D05RikJ3QK56 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
4930544D05RikJ3QK56 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
4930544D05RikJ3QK56 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
4930544D05RikJ3QK56 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
4930544D05RikJ3QK56 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
4930544D05RikJ3QK56 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
4930544D05RikJ3QK56 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
4930544D05RikJ3QK56 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
4930544D05RikJ3QK56 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
4930544D05RikJ3QK56 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
4930544D05RikJ3QK56 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
4930544D05RikJ3QK56 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
4930544D05RikJ3QK56 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
4930544D05RikJ3QK56 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
4930544D05RikJ3QK56 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
4930544D05RikJ3QK56 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
4930544D05RikJ3QK56 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
4930544D05RikJ3QK56 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
4930544D05RikJ3QK56 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
4930544D05RikJ3QK56 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
4930544D05RikJ3QK56 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
4930544D05RikJ3QK56 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
4930544D05RikJ3QK56 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
4930544D05RikJ3QK56 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
4930544D05RikJ3QK56 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
4930544D05RikJ3QK56 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
4930544D05RikJ3QK56 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
4930544D05RikJ3QK56 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
4930544D05RikJ3QK56 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
4930544D05RikJ3QK56 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
4930544D05RikJ3QK56 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
4930544D05RikJ3QK56 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
4930544D05RikJ3QK56 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
4930544D05RikJ3QK56 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
4930544D05RikJ3QK56 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
4930544D05RikJ3QK56 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
4930544D05RikJ3QK56 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
4930544D05RikJ3QK56 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
4930544D05RikJ3QK56 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
4930544D05RikJ3QK56 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
4930544D05RikJ3QK56 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
4930544D05RikJ3QK56 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
4930544D05RikJ3QK56 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
4930544D05RikJ3QK56 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
4930544D05RikJ3QK56 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
4930544D05RikJ3QK56 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
4930544D05RikJ3QK56 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
4930544D05RikJ3QK56 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
4930544D05RikJ3QK56 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
4930544D05RikJ3QK56 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
4930544D05RikJ3QK56 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
4930544D05RikJ3QK56 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
4930544D05RikJ3QK56 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
4930544D05RikJ3QK56 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
4930544D05RikJ3QK56 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
4930544D05RikJ3QK56 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
4930544D05RikJ3QK56 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
4930544D05RikJ3QK56 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
4930544D05RikJ3QK56 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.7 ms