Protein–RNA interactions for Protein: I3ITR1

AK157302, MCG50313, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AK157302I3ITR1 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
AK157302I3ITR1 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
AK157302I3ITR1 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
AK157302I3ITR1 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
AK157302I3ITR1 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
AK157302I3ITR1 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
AK157302I3ITR1 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
AK157302I3ITR1 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
AK157302I3ITR1 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
AK157302I3ITR1 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
AK157302I3ITR1 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
AK157302I3ITR1 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
AK157302I3ITR1 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
AK157302I3ITR1 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
AK157302I3ITR1 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
AK157302I3ITR1 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
AK157302I3ITR1 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
AK157302I3ITR1 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
AK157302I3ITR1 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
AK157302I3ITR1 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
AK157302I3ITR1 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
AK157302I3ITR1 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
AK157302I3ITR1 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
AK157302I3ITR1 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
AK157302I3ITR1 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
AK157302I3ITR1 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
AK157302I3ITR1 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
AK157302I3ITR1 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
AK157302I3ITR1 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
AK157302I3ITR1 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
AK157302I3ITR1 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
AK157302I3ITR1 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
AK157302I3ITR1 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
AK157302I3ITR1 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
AK157302I3ITR1 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
AK157302I3ITR1 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
AK157302I3ITR1 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
AK157302I3ITR1 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
AK157302I3ITR1 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
AK157302I3ITR1 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
AK157302I3ITR1 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
AK157302I3ITR1 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
AK157302I3ITR1 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
AK157302I3ITR1 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
AK157302I3ITR1 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
AK157302I3ITR1 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
AK157302I3ITR1 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
AK157302I3ITR1 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
AK157302I3ITR1 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
AK157302I3ITR1 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
AK157302I3ITR1 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
AK157302I3ITR1 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
AK157302I3ITR1 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
AK157302I3ITR1 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
AK157302I3ITR1 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
AK157302I3ITR1 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
AK157302I3ITR1 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
AK157302I3ITR1 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
AK157302I3ITR1 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
AK157302I3ITR1 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
AK157302I3ITR1 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
AK157302I3ITR1 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
AK157302I3ITR1 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
AK157302I3ITR1 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
AK157302I3ITR1 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
AK157302I3ITR1 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
AK157302I3ITR1 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
AK157302I3ITR1 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
AK157302I3ITR1 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
AK157302I3ITR1 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
AK157302I3ITR1 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
AK157302I3ITR1 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
AK157302I3ITR1 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
AK157302I3ITR1 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
AK157302I3ITR1 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
AK157302I3ITR1 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
AK157302I3ITR1 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
AK157302I3ITR1 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
AK157302I3ITR1 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
AK157302I3ITR1 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
AK157302I3ITR1 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
AK157302I3ITR1 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
AK157302I3ITR1 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
AK157302I3ITR1 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
AK157302I3ITR1 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
AK157302I3ITR1 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
AK157302I3ITR1 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
AK157302I3ITR1 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
AK157302I3ITR1 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
AK157302I3ITR1 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
AK157302I3ITR1 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
AK157302I3ITR1 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
AK157302I3ITR1 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
AK157302I3ITR1 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
AK157302I3ITR1 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
AK157302I3ITR1 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
AK157302I3ITR1 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
AK157302I3ITR1 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
AK157302I3ITR1 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
AK157302I3ITR1 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms